More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3290 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 506 aa  974    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  68.12 
 
 		 515 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  66.8 
 
 		 487 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.11 
 
 		 491 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.4 
 
 		 491 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  61.65 
 
 		 484 aa  554  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  60.84 
 
 		 494 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.17 
 
 		 490 aa  534  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.89 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.17 
 
 		 490 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.09 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  58.26 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  57.14 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.26 
 
 		 481 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.23 
 
 		 480 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.99 
 
 		 486 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.51 
 
 		 518 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 		 521 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.74 
 
 		 498 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.13 
 
 		 507 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  55.47 
 
 		 493 aa  487  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.3 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.84 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.75 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.38 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.3 
 
 		 483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.12 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.72 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  55.85 
 
 		 496 aa  438  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.07 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.49 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.49 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.49 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.67 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.98 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.6 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.36 
 
 		 496 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.01 
 
 		 456 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.47 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.47 
 
 		 456 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.58 
 
 		 460 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 		 442 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.3 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.71 
 
 		 441 aa  287  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 		 460 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.36 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.63 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.28 
 
 		 437 aa  276  8e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.53 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.51 
 
 		 471 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.74 
 
 		 441 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.89 
 
 		 446 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.59 
 
 		 453 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.84 
 
 		 438 aa  269  8e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  36.61 
 
 		 444 aa  269  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.57 
 
 		 452 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.41 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.36 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.9 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.77 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.78 
 
 		 457 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.33 
 
 		 437 aa  266  7e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.42 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.68 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.16 
 
 		 436 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.81 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 433 aa  260  3e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.24 
 
 		 433 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 433 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 436 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.52 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.52 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.37 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.19 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.96 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.48 
 
 		 443 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.89 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  39.31 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  37.84 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.77 
 
 		 476 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2711  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.21 
 
 		 448 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.172353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.16 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  34.48 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1528  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 		 440 aa  253  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000884717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.53 
 
 		 465 aa  252  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  37.84 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  36.71 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.08 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  34.58 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  36.86 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  36.33 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.24 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.76 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.42 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.42 
 
 		 446 aa  247  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  35.6 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.55 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.29 
 
 		 433 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  35.58 
 
 		 453 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>