More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0209 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
476 aa  925    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.61 
 
 
465 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4073  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.24 
 
 
470 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  59.45 
 
 
464 aa  520  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.08 
 
 
453 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0225  purine transporter, AzgA family  58.58 
 
 
464 aa  510  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.72 
 
 
473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  51.13 
 
 
473 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1894  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.64 
 
 
473 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.35 
 
 
482 aa  441  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.37 
 
 
473 aa  409  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.503349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.58 
 
 
460 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.32 
 
 
462 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.02 
 
 
440 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  46.37 
 
 
429 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  45.51 
 
 
429 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  45.96 
 
 
430 aa  364  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.09 
 
 
433 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  45.11 
 
 
430 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 
453 aa  359  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.47 
 
 
446 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.64 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.2 
 
 
434 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 
432 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.2 
 
 
434 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.78 
 
 
431 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.51 
 
 
442 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.59 
 
 
430 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.99 
 
 
431 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.56 
 
 
441 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.78 
 
 
431 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.3 
 
 
431 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.2 
 
 
441 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.56 
 
 
431 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.04 
 
 
446 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.58 
 
 
452 aa  346  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 
431 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  44.56 
 
 
431 aa  346  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  42.95 
 
 
434 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  44.21 
 
 
430 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.78 
 
 
430 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.35 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.95 
 
 
430 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  42.74 
 
 
433 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.28 
 
 
454 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.65 
 
 
463 aa  342  8e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 
433 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.52 
 
 
433 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  42.31 
 
 
433 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  42.31 
 
 
433 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  42.31 
 
 
433 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  44.09 
 
 
430 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  42.09 
 
 
433 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.8 
 
 
433 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.82 
 
 
458 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  42.43 
 
 
453 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 
433 aa  339  7e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.45 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.31 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.22 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.38 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.09 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.38 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.32 
 
 
457 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.8 
 
 
433 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.45 
 
 
433 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.45 
 
 
433 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.45 
 
 
433 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.89 
 
 
446 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.66 
 
 
431 aa  333  5e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  44.42 
 
 
429 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  43.99 
 
 
429 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  42.58 
 
 
453 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.26 
 
 
446 aa  329  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 
449 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.74 
 
 
449 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.31 
 
 
449 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.9 
 
 
429 aa  326  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.35 
 
 
465 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.31 
 
 
449 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  40.9 
 
 
449 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 
429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  40.9 
 
 
449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 
446 aa  319  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.79 
 
 
467 aa  319  7e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.51 
 
 
451 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.51 
 
 
449 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
431 aa  318  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 
429 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.84 
 
 
441 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.93 
 
 
438 aa  316  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.67 
 
 
441 aa  316  5e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.45 
 
 
435 aa  316  5e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 
429 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.98 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  41.6 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  41.6 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0341  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.3 
 
 
438 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.16 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>