More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1894 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1894  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
473 aa  925    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  59.25 
 
 
473 aa  547  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4073  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.58 
 
 
470 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669664  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.62 
 
 
473 aa  533  1e-150  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.83 
 
 
453 aa  528  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  56.33 
 
 
464 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.13 
 
 
482 aa  485  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0225  purine transporter, AzgA family  55.49 
 
 
464 aa  476  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.75 
 
 
476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.68 
 
 
465 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.23 
 
 
473 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.503349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.4 
 
 
460 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.06 
 
 
440 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.53 
 
 
462 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.83 
 
 
446 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
433 aa  324  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.77 
 
 
430 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.67 
 
 
453 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.55 
 
 
452 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  41.65 
 
 
430 aa  312  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  41.65 
 
 
430 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  40.69 
 
 
429 aa  312  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.71 
 
 
446 aa  312  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  40.09 
 
 
429 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.61 
 
 
446 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.38 
 
 
442 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.77 
 
 
436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  40.47 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 
446 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.1 
 
 
454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.3 
 
 
432 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.19 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.88 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.04 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.74 
 
 
435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.08 
 
 
444 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.08 
 
 
444 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.76 
 
 
449 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.97 
 
 
431 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.34 
 
 
437 aa  302  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.83 
 
 
441 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.4 
 
 
443 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.98 
 
 
429 aa  300  3e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.24 
 
 
463 aa  300  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.58 
 
 
431 aa  299  9e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 
433 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  39.92 
 
 
441 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  39.19 
 
 
430 aa  297  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 
434 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.26 
 
 
433 aa  296  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.83 
 
 
434 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.92 
 
 
441 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  39.92 
 
 
441 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  39.92 
 
 
441 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  39.92 
 
 
441 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  39.92 
 
 
441 aa  296  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  39.92 
 
 
441 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.47 
 
 
433 aa  296  8e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  39.71 
 
 
441 aa  295  9e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.9 
 
 
433 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  37.31 
 
 
434 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  39.71 
 
 
441 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.97 
 
 
429 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.12 
 
 
433 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  37.04 
 
 
433 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  39.5 
 
 
441 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  40.55 
 
 
429 aa  294  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  37.11 
 
 
444 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.66 
 
 
429 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.69 
 
 
431 aa  292  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  37.37 
 
 
433 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  37.37 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  37.02 
 
 
433 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  37.37 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  37.37 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  39.5 
 
 
442 aa  291  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.5 
 
 
442 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.97 
 
 
431 aa  291  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.38 
 
 
431 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  39.5 
 
 
442 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.87 
 
 
429 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.21 
 
 
429 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.02 
 
 
433 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 
429 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.17 
 
 
431 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.17 
 
 
433 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.26 
 
 
453 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.47 
 
 
471 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.74 
 
 
429 aa  290  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 
429 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.49 
 
 
438 aa  289  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.55 
 
 
467 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  39.66 
 
 
429 aa  289  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.6 
 
 
433 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.28 
 
 
430 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 
429 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  38.59 
 
 
431 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>