More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4161 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  76.35 
 
 
444 aa  683    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  76.13 
 
 
444 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  76.13 
 
 
444 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  99.77 
 
 
442 aa  867    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  100 
 
 
442 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.77 
 
 
442 aa  867    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  88.86 
 
 
445 aa  739    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  76.35 
 
 
470 aa  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  76.35 
 
 
470 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  87.04 
 
 
445 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  87.04 
 
 
445 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  85.15 
 
 
445 aa  723    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  87.04 
 
 
445 aa  740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  87.04 
 
 
445 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  85 
 
 
445 aa  754    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  76.35 
 
 
448 aa  684    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  86.57 
 
 
446 aa  720    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  91.78 
 
 
445 aa  782    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  87.04 
 
 
445 aa  741    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4208  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  85.88 
 
 
445 aa  731    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  76.13 
 
 
470 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  87.04 
 
 
445 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  89.55 
 
 
445 aa  748    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  76.35 
 
 
444 aa  683    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4239  xanthine/uracil permease family protein  72.69 
 
 
389 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034551  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  68.59 
 
 
436 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.05 
 
 
461 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.91 
 
 
429 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.67 
 
 
429 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.67 
 
 
429 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.91 
 
 
431 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.44 
 
 
429 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.5 
 
 
429 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 
429 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  55.58 
 
 
431 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 
429 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 
429 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  55.35 
 
 
431 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  53.74 
 
 
429 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  53.04 
 
 
429 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.74 
 
 
429 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  54.82 
 
 
429 aa  472  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.04 
 
 
429 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 
429 aa  471  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.04 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.04 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.04 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  55.29 
 
 
430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  53.72 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.19 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.07 
 
 
430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.19 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.06 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  54.59 
 
 
429 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  53.26 
 
 
449 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  53.02 
 
 
449 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.42 
 
 
432 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  53.5 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.69 
 
 
449 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.26 
 
 
431 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.71 
 
 
446 aa  458  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.46 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
449 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.1 
 
 
431 aa  448  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
449 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
449 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.21 
 
 
430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.64 
 
 
446 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.02 
 
 
438 aa  443  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.76 
 
 
430 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.44 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  54.44 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  54.44 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.18 
 
 
454 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  51.26 
 
 
494 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.9 
 
 
446 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 
434 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.1 
 
 
453 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 
434 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.45 
 
 
446 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  50.24 
 
 
433 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.24 
 
 
433 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  50.68 
 
 
453 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.24 
 
 
433 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  49.42 
 
 
434 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  50.82 
 
 
453 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
433 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.04 
 
 
449 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
433 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
433 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
433 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>