More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0238 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  91.84 
 
 
441 aa  803    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
441 aa  859    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.98 
 
 
441 aa  616  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  70.98 
 
 
441 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  70.75 
 
 
441 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  70.75 
 
 
441 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  70.75 
 
 
441 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  70.52 
 
 
441 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  71.2 
 
 
441 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  70.75 
 
 
441 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  70.75 
 
 
441 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  70.75 
 
 
441 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.84 
 
 
441 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.63 
 
 
444 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.63 
 
 
444 aa  551  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  60.59 
 
 
444 aa  544  1e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.14 
 
 
431 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 
435 aa  473  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.32 
 
 
436 aa  451  1e-125  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.05 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0499  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.01 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000767859  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.7 
 
 
455 aa  432  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.8 
 
 
433 aa  432  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.57 
 
 
433 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
433 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.57 
 
 
452 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
433 aa  427  1e-118  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.46 
 
 
431 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.11 
 
 
460 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  49.1 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.18 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  48.64 
 
 
431 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.08 
 
 
431 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  49.2 
 
 
429 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  49.89 
 
 
430 aa  394  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.08 
 
 
431 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.08 
 
 
441 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.31 
 
 
431 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  49.08 
 
 
431 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.31 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  48.75 
 
 
429 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  48.64 
 
 
430 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.24 
 
 
429 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.19 
 
 
431 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.49 
 
 
441 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.24 
 
 
429 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.24 
 
 
429 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.49 
 
 
433 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.39 
 
 
432 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.39 
 
 
431 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.55 
 
 
429 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.24 
 
 
429 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  45.56 
 
 
429 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 
429 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.15 
 
 
433 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.91 
 
 
433 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.79 
 
 
429 aa  368  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.79 
 
 
429 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 
429 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  45.79 
 
 
429 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 
429 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  46.03 
 
 
430 aa  364  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
453 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.79 
 
 
431 aa  364  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.13 
 
 
465 aa  362  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  45.8 
 
 
430 aa  362  6e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.09 
 
 
454 aa  362  7.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  48.64 
 
 
494 aa  362  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 
434 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 
434 aa  362  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 
429 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.35 
 
 
430 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.34 
 
 
446 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 
429 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.8 
 
 
433 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  44.9 
 
 
434 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  45.7 
 
 
433 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.68 
 
 
432 aa  360  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 
429 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 
429 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.72 
 
 
433 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.72 
 
 
433 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.72 
 
 
433 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.48 
 
 
430 aa  359  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.22 
 
 
465 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.25 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  45.35 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.85 
 
 
430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  44.55 
 
 
449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.82 
 
 
433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.23 
 
 
446 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
431 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  44.8 
 
 
433 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  45.02 
 
 
433 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.82 
 
 
433 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  44.8 
 
 
433 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  44.8 
 
 
433 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  44.8 
 
 
433 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>