More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0375 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  79.66 
 
 		 473 aa  762    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 473 aa  924    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4073  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.18 
 
 		 470 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669664  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1894  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.62 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  54.18 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0225  purine transporter, AzgA family  54.6 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.67 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.02 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.39 
 
 		 482 aa  425  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.67 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.89 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.503349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.26 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.74 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  42.95 
 
 		 430 aa  357  3.9999999999999996e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.04 
 
 		 441 aa  348  9e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  41.49 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.7 
 
 		 436 aa  342  8e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.04 
 
 		 463 aa  342  9e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  39.96 
 
 		 429 aa  342  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.61 
 
 		 437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  40.38 
 
 		 430 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.76 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.68 
 
 		 442 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.8 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.97 
 
 		 446 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.92 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.92 
 
 		 434 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 		 453 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.74 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.61 
 
 		 430 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.18 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.87 
 
 		 454 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.1 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.43 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.89 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  41.11 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  40.9 
 
 		 431 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  41.11 
 
 		 431 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.21 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  41.53 
 
 		 430 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.79 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  41.4 
 
 		 430 aa  323  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.25 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 449 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  39.19 
 
 		 453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.71 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.06 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.43 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  38.59 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.33 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  39.18 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.54 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.85 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.17 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.34 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.56 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.9 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  40.9 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.71 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  38.12 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.66 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  39.57 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  38.12 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.43 
 
 		 452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.02 
 
 		 431 aa  309  8e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.42 
 
 		 432 aa  309  8e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.04 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  38.83 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.89 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  37.69 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  37.69 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  37.69 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  38.83 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  38.83 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.21 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  38.62 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  38.62 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  38.62 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  38.62 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  39.23 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.81 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.19 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.79 
 
 		 429 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.17 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  39.32 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  39.32 
 
 		 445 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  39.32 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.53 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  39.32 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.79 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>