More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1020 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
465 aa  913    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.59 
 
 
467 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.95 
 
 
471 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 
433 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.43 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.43 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.65 
 
 
460 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.09 
 
 
440 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.15 
 
 
433 aa  393  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  48.31 
 
 
429 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.58 
 
 
433 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  47.86 
 
 
429 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.41 
 
 
437 aa  378  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.72 
 
 
436 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
441 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  45.31 
 
 
430 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0441  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.32 
 
 
446 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.783527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.89 
 
 
441 aa  362  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.22 
 
 
441 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.59 
 
 
442 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  44.44 
 
 
429 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.65 
 
 
429 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.39 
 
 
441 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.07 
 
 
451 aa  359  6e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.66 
 
 
434 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.66 
 
 
434 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0341  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.91 
 
 
438 aa  358  9e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0323  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.21 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  46.49 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  46.71 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  46.94 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 
444 aa  355  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 
444 aa  355  5.999999999999999e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.32 
 
 
430 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.45 
 
 
428 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.72 
 
 
435 aa  354  2e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  43.44 
 
 
444 aa  351  1e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  42.44 
 
 
434 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.83 
 
 
433 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.18 
 
 
431 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
441 aa  348  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  43.5 
 
 
465 aa  348  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.14 
 
 
435 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  43.85 
 
 
465 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.94 
 
 
446 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.95 
 
 
431 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.43 
 
 
449 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  42.6 
 
 
433 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.6 
 
 
433 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  43.41 
 
 
431 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.18 
 
 
431 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.5 
 
 
431 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  42.37 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.5 
 
 
446 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  42.37 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  42.37 
 
 
433 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.63 
 
 
441 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.93 
 
 
446 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  44.11 
 
 
433 aa  343  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.27 
 
 
431 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 
429 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 
449 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.69 
 
 
443 aa  342  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.78 
 
 
449 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  42.73 
 
 
433 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.87 
 
 
429 aa  342  9e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.57 
 
 
449 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 
429 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 
429 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 
429 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.08 
 
 
431 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.95 
 
 
432 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.41 
 
 
429 aa  340  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.44 
 
 
449 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.94 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.16 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.01 
 
 
463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
433 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.44 
 
 
431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.74 
 
 
429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.54 
 
 
431 aa  339  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.51 
 
 
429 aa  338  9e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0848  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.67 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.614124  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  42.56 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  42.33 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.46 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.28 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.51 
 
 
429 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.46 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.76 
 
 
454 aa  335  7e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.08 
 
 
453 aa  336  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  42.11 
 
 
453 aa  335  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  41.82 
 
 
431 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>