More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0225 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0225  purine transporter, AzgA family  100 
 
 		 464 aa  921    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  79.31 
 
 		 464 aa  714    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4073  Xanthine/uracil/vitamin C permease  65.02 
 
 		 470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.42 
 
 		 453 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.71 
 
 		 476 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.36 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  54.79 
 
 		 473 aa  510  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.6 
 
 		 473 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1894  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.49 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190312  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.27 
 
 		 482 aa  444  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.63 
 
 		 473 aa  414  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.503349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.85 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.03 
 
 		 462 aa  346  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.01 
 
 		 440 aa  342  5.999999999999999e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  43.72 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.07 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.07 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  42.42 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.42 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.77 
 
 		 431 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.77 
 
 		 441 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  39.43 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.91 
 
 		 453 aa  322  8e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.77 
 
 		 431 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  39.87 
 
 		 429 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.96 
 
 		 454 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.82 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 452 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  41.77 
 
 		 431 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  41.56 
 
 		 431 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.87 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.61 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  40.04 
 
 		 430 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  39 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.52 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  40.61 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.25 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.3 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.72 
 
 		 463 aa  306  5.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.3 
 
 		 433 aa  306  6e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  40.48 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.99 
 
 		 433 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.21 
 
 		 437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.75 
 
 		 442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.43 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  39 
 
 		 429 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.78 
 
 		 441 aa  303  3.0000000000000004e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  38.43 
 
 		 433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.53 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.53 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.22 
 
 		 433 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.43 
 
 		 449 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.74 
 
 		 446 aa  302  9e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.96 
 
 		 455 aa  302  9e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  38.65 
 
 		 434 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.45 
 
 		 444 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.45 
 
 		 444 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.27 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.68 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  38.13 
 
 		 453 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.26 
 
 		 430 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.89 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.31 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.87 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.91 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.25 
 
 		 438 aa  297  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  39.74 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  37.12 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.22 
 
 		 429 aa  296  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  36.9 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  36.9 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  36.9 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.74 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  37.87 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  38.34 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  38.27 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.88 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.31 
 
 		 429 aa  295  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.58 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  36.88 
 
 		 433 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  39 
 
 		 429 aa  293  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  38.56 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.78 
 
 		 429 aa  292  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.66 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.49 
 
 		 457 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  38.68 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.48 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.48 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  39 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.12 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  38.46 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  38.46 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  38.46 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  38.46 
 
 		 441 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.58 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.17 
 
 		 436 aa  290  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  39 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>