More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2372 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 457 aa  889    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  75.76 
 
 		 458 aa  672    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.43 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.55 
 
 		 460 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 		 433 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.56 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.3 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.89 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.57 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.57 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.71 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.05 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  46.58 
 
 		 429 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  45.05 
 
 		 431 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.98 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  46.34 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.14 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.34 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  46.2 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  45.92 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.05 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  46.22 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.76 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  45.03 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.62 
 
 		 431 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  45.83 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.36 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  42.67 
 
 		 445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.2 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 446 aa  362  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  45.39 
 
 		 431 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  45.73 
 
 		 453 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.85 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.64 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.8 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.11 
 
 		 437 aa  360  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  42.45 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  42.45 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  42.45 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.98 
 
 		 431 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.15 
 
 		 430 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.98 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.42 
 
 		 446 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.91 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  43.14 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  45.47 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.34 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.21 
 
 		 446 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  43.17 
 
 		 433 aa  354  1e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  43.17 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  43.17 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.64 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  45.2 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  45.25 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.17 
 
 		 446 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  43.7 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.71 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  43.64 
 
 		 433 aa  350  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.04 
 
 		 446 aa  349  5e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.48 
 
 		 429 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  43.94 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  44.18 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  43.42 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  43.42 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  43.94 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  43.42 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.7 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.94 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.27 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.04 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.04 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  43.05 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.21 
 
 		 433 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.04 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.45 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.04 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.04 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  42.45 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  42.45 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  42.45 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.45 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  42.45 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  42.45 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.2 
 
 		 433 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  47.36 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  42.23 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.38 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.61 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  42.11 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.74 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.63 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.2 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>