More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0393 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
437 aa  853    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  57.58 
 
 
429 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  57.81 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.12 
 
 
436 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.34 
 
 
460 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.76 
 
 
440 aa  432  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  50.93 
 
 
430 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  50.47 
 
 
429 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
441 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  50.47 
 
 
429 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  50.82 
 
 
433 aa  415  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  48.95 
 
 
430 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.63 
 
 
433 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.53 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.18 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  48.12 
 
 
431 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  48.12 
 
 
431 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.98 
 
 
433 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
431 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
431 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.28 
 
 
433 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.74 
 
 
433 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  51.51 
 
 
434 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.24 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.77 
 
 
441 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.18 
 
 
431 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.77 
 
 
431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.84 
 
 
429 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  46.26 
 
 
429 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
429 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.84 
 
 
429 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.06 
 
 
431 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.84 
 
 
429 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.84 
 
 
429 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.64 
 
 
442 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.9 
 
 
432 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 
429 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.34 
 
 
446 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.95 
 
 
431 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.88 
 
 
431 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.25 
 
 
428 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  47.42 
 
 
465 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  47.42 
 
 
465 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
429 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.03 
 
 
429 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.26 
 
 
429 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.2 
 
 
430 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  45.88 
 
 
431 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.44 
 
 
433 aa  381  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  44.08 
 
 
449 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.11 
 
 
446 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.56 
 
 
429 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.86 
 
 
429 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.84 
 
 
462 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.79 
 
 
463 aa  378  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.21 
 
 
465 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  43.85 
 
 
449 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.29 
 
 
449 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  44.88 
 
 
494 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.06 
 
 
449 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.48 
 
 
467 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.82 
 
 
449 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.33 
 
 
429 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.24 
 
 
446 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.72 
 
 
454 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  44.26 
 
 
429 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.36 
 
 
449 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  47.7 
 
 
428 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.33 
 
 
471 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.59 
 
 
449 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  43.49 
 
 
442 aa  362  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
442 aa  362  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  43.26 
 
 
442 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.6 
 
 
429 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 
434 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.53 
 
 
431 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.06 
 
 
434 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0341  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.29 
 
 
438 aa  360  3e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  44.34 
 
 
453 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  45.48 
 
 
453 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0323  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.06 
 
 
438 aa  358  8e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.72 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.6 
 
 
433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.2 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  44.34 
 
 
444 aa  356  5e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.73 
 
 
446 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.56 
 
 
457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  42.19 
 
 
434 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.49 
 
 
446 aa  353  5e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  41.49 
 
 
445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.31 
 
 
430 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  41.26 
 
 
445 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  41.26 
 
 
445 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
444 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 
444 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  41.26 
 
 
445 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.36 
 
 
449 aa  351  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  44.39 
 
 
430 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>