More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0202 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  84.56 
 
 
446 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  80.76 
 
 
446 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  81.07 
 
 
449 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
446 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  73.49 
 
 
432 aa  634    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  81.66 
 
 
446 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.86 
 
 
453 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.44 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.44 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  71.5 
 
 
433 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.73 
 
 
433 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  71.66 
 
 
453 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  67.82 
 
 
434 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  68.69 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  68.69 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.39 
 
 
433 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  68.93 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  70.64 
 
 
453 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.39 
 
 
433 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  70.33 
 
 
433 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  68.93 
 
 
433 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.39 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  68.69 
 
 
433 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.39 
 
 
433 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  69.39 
 
 
433 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  69.16 
 
 
433 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.36 
 
 
454 aa  530  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  62.5 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.7 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  61.08 
 
 
430 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  60.76 
 
 
430 aa  508  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.2 
 
 
431 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  58.96 
 
 
431 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  58.73 
 
 
431 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.96 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.67 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  58.25 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.2 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.49 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.76 
 
 
431 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.69 
 
 
441 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.73 
 
 
431 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  57.51 
 
 
430 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.87 
 
 
429 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.57 
 
 
429 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.87 
 
 
429 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  56.34 
 
 
429 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.74 
 
 
438 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  56.24 
 
 
429 aa  479  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.16 
 
 
429 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  55.63 
 
 
429 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.69 
 
 
429 aa  478  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.69 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  54.91 
 
 
430 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.69 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.69 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.93 
 
 
429 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.3 
 
 
446 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 
429 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.69 
 
 
429 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.63 
 
 
431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.23 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.12 
 
 
449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.99 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  53.99 
 
 
429 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.13 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.76 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  54.21 
 
 
449 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.15 
 
 
449 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.15 
 
 
449 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.15 
 
 
449 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.38 
 
 
449 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  53.74 
 
 
449 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  58.12 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  56 
 
 
430 aa  460  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.16 
 
 
432 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  51.64 
 
 
442 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  49.65 
 
 
436 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  49.43 
 
 
445 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.4 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  49.21 
 
 
445 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  49.66 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  51.4 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  49.43 
 
 
445 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
445 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 
446 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.47 
 
 
431 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03598  predicted inner membrane protein  49.2 
 
 
445 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4253  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.43 
 
 
445 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03542  hypothetical protein  49.2 
 
 
445 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.29 
 
 
445 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3208  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.35 
 
 
436 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238917  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.7 
 
 
433 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.16 
 
 
433 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3928  sulfate permease family inorganic anion transporter  49.2 
 
 
445 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.36 
 
 
445 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5145  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  49.2 
 
 
445 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.164927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  49.2 
 
 
445 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  49.43 
 
 
445 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.2 
 
 
445 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>