More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3346 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 453 aa  889    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4073  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.09 
 
 		 470 aa  628  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000669664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  65.3 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0225  purine transporter, AzgA family  61.42 
 
 		 464 aa  551  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0209  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.13 
 
 		 476 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.746672  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.82 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1894  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.83 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0190312  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  51.57 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0375  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.09 
 
 		 473 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0414  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.76 
 
 		 482 aa  456  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.222193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1119  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.25 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.503349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.78 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.08 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.67 
 
 		 462 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.89 
 
 		 429 aa  350  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  44.67 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  45.13 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.92 
 
 		 436 aa  343  5e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.35 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.6 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.04 
 
 		 431 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.64 
 
 		 441 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  43.36 
 
 		 430 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.15 
 
 		 441 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  44.27 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.15 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.04 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.11 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.51 
 
 		 453 aa  325  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.05 
 
 		 467 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.52 
 
 		 433 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.86 
 
 		 433 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.19 
 
 		 465 aa  322  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.24 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.85 
 
 		 433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 		 431 aa  320  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.62 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.94 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.15 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.87 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.75 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  41.11 
 
 		 453 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  40.8 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.78 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.45 
 
 		 463 aa  316  6e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  41.43 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.98 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  41.43 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.74 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.88 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  41.41 
 
 		 430 aa  313  5.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.49 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.54 
 
 		 430 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  41.19 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.84 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.4 
 
 		 454 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.35 
 
 		 433 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.57 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.3 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.65 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.35 
 
 		 446 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.08 
 
 		 442 aa  310  5e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  39.91 
 
 		 433 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.82 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.47 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.29 
 
 		 446 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.67 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  41.33 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  42.19 
 
 		 494 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.04 
 
 		 436 aa  306  6e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.13 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.13 
 
 		 444 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.4 
 
 		 432 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.42 
 
 		 446 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.73 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.51 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.95 
 
 		 433 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  39.69 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.18 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  39.69 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  39.69 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.37 
 
 		 455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  42.98 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 		 457 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.57 
 
 		 432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  39.61 
 
 		 441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  39.61 
 
 		 441 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.33 
 
 		 449 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.2 
 
 		 446 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  39.39 
 
 		 441 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  39.39 
 
 		 441 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.72 
 
 		 431 aa  303  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>