More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1565 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
431 aa  839    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  77.49 
 
 
431 aa  688    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  66.04 
 
 
429 aa  574  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  66.9 
 
 
430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  65.73 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  66.74 
 
 
430 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  64.32 
 
 
431 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.89 
 
 
429 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.69 
 
 
430 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.66 
 
 
429 aa  544  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.19 
 
 
429 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.23 
 
 
430 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  61.12 
 
 
431 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.66 
 
 
429 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.65 
 
 
431 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.78 
 
 
429 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  61.12 
 
 
431 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  60.66 
 
 
429 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  60.19 
 
 
429 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.42 
 
 
429 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.42 
 
 
429 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.95 
 
 
429 aa  531  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  60 
 
 
431 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  60 
 
 
431 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.72 
 
 
429 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.94 
 
 
431 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.18 
 
 
441 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.19 
 
 
429 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.94 
 
 
431 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.47 
 
 
431 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.72 
 
 
429 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.72 
 
 
429 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.72 
 
 
429 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.55 
 
 
429 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.71 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  57.94 
 
 
449 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  58.18 
 
 
449 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.58 
 
 
432 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.05 
 
 
431 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.68 
 
 
434 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.68 
 
 
434 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.61 
 
 
449 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  55.45 
 
 
434 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.84 
 
 
449 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.61 
 
 
449 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.61 
 
 
449 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.14 
 
 
449 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.22 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  57.41 
 
 
494 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  55.45 
 
 
433 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.68 
 
 
433 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.68 
 
 
433 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  55.45 
 
 
433 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.6 
 
 
433 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  55.22 
 
 
433 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  55.22 
 
 
433 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  55.22 
 
 
433 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.45 
 
 
433 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.68 
 
 
432 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  54.91 
 
 
453 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  55.22 
 
 
433 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.63 
 
 
446 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.22 
 
 
433 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.22 
 
 
433 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.22 
 
 
433 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.28 
 
 
453 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  55.61 
 
 
453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.31 
 
 
446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.84 
 
 
446 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 
430 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.4 
 
 
446 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.45 
 
 
454 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  54.69 
 
 
430 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.36 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.36 
 
 
433 aa  456  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.93 
 
 
449 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  54.23 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.13 
 
 
433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.7 
 
 
461 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  52.1 
 
 
442 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.1 
 
 
430 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.35 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.58 
 
 
445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  51.87 
 
 
442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.87 
 
 
442 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  50.23 
 
 
445 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  50.23 
 
 
445 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  50.23 
 
 
445 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  50.12 
 
 
436 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  50.23 
 
 
445 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.21 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.5 
 
 
445 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.17 
 
 
446 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0570  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 
438 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.46787  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.1 
 
 
445 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  49.57 
 
 
482 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.41 
 
 
445 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 
433 aa  430  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  49.07 
 
 
470 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4223  sulfate permease family inorganic anion transporter  50.47 
 
 
445 aa  427  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>