More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1869 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
438 aa  859    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  67.82 
 
 
436 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  65.72 
 
 
455 aa  574  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.28 
 
 
431 aa  495  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.66 
 
 
435 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0499  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.78 
 
 
444 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000767859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.28 
 
 
441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.05 
 
 
441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.77 
 
 
444 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.77 
 
 
444 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  49.55 
 
 
444 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.23 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.84 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.62 
 
 
460 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  49.54 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  49.32 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  49.32 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  49.09 
 
 
441 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  49.32 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  49.32 
 
 
441 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  49.54 
 
 
441 aa  409  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  49.32 
 
 
441 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.86 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  49.32 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.68 
 
 
433 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.11 
 
 
433 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 
433 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  46.08 
 
 
430 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.83 
 
 
440 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.36 
 
 
452 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  45.35 
 
 
429 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.07 
 
 
431 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  44.6 
 
 
431 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.16 
 
 
433 aa  370  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  44.94 
 
 
429 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 
431 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.6 
 
 
431 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.37 
 
 
431 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.31 
 
 
431 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 
431 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 
441 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.37 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  44.68 
 
 
430 aa  361  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.39 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.59 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.92 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.69 
 
 
449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  42.39 
 
 
431 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.92 
 
 
449 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.92 
 
 
449 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.86 
 
 
430 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.13 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.96 
 
 
433 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.65 
 
 
433 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 
446 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0609  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 
430 aa  348  8e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00599511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  41.96 
 
 
449 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0763  xanthine/uracil permease family protein  44.57 
 
 
430 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0822  xanthine/uracil permease family protein  44.57 
 
 
430 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00127889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.08 
 
 
429 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4609  xanthine/uracil permease family protein  44.57 
 
 
430 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.161431  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.56 
 
 
429 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.9 
 
 
442 aa  346  4e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.96 
 
 
432 aa  346  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.49 
 
 
441 aa  346  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  41.72 
 
 
449 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  44.55 
 
 
429 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  44.35 
 
 
465 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0605  xanthine/uracil permease family protein  44.11 
 
 
430 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00328117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  43.9 
 
 
465 aa  342  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0604  xanthine/uracil permease family protein  44.11 
 
 
430 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  43.85 
 
 
429 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0749  xanthine/uracil permease family protein  44.11 
 
 
430 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000483124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0660  xanthine/uracil permease family protein  44.34 
 
 
430 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.177816  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.19 
 
 
436 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0694  xanthine/uracil permease family protein  44.34 
 
 
430 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0726  xanthine/uracil permease family protein  43.88 
 
 
430 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  43.19 
 
 
433 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.56 
 
 
431 aa  339  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.95 
 
 
430 aa  338  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.7 
 
 
429 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 
429 aa  336  5e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  42.96 
 
 
433 aa  336  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0666  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.49 
 
 
433 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.23 
 
 
429 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 
429 aa  333  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  43.12 
 
 
494 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  40.73 
 
 
434 aa  332  8e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 
429 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 
429 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  40 
 
 
429 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 
429 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>