More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2302 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
431 aa  846    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.09 
 
 
441 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.95 
 
 
441 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.14 
 
 
441 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  57.27 
 
 
441 aa  501  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  57.5 
 
 
441 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  57.5 
 
 
441 aa  502  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  57.5 
 
 
441 aa  502  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  57.5 
 
 
441 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  57.73 
 
 
441 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  57.5 
 
 
441 aa  502  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  57.95 
 
 
441 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  57.27 
 
 
441 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0254  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.73 
 
 
441 aa  500  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000390188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  53.95 
 
 
444 aa  487  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 
444 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 
444 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.21 
 
 
435 aa  472  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1865  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.74 
 
 
436 aa  443  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000195925  hitchhiker  0.00000000000416015 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.6 
 
 
455 aa  432  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1869  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.84 
 
 
438 aa  426  1e-118  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000010508  hitchhiker  0.00000000167623 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0499  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.95 
 
 
444 aa  420  1e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000767859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.41 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.34 
 
 
452 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.96 
 
 
433 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.49 
 
 
433 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.03 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.09 
 
 
460 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.24 
 
 
433 aa  396  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.4 
 
 
440 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.81 
 
 
433 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.85 
 
 
431 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  44.7 
 
 
431 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.2 
 
 
433 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  47.58 
 
 
430 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  44.47 
 
 
431 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  46.51 
 
 
429 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.81 
 
 
430 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.01 
 
 
431 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.16 
 
 
431 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.24 
 
 
431 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.73 
 
 
433 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.78 
 
 
429 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.33 
 
 
431 aa  363  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.01 
 
 
431 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.01 
 
 
441 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  44.47 
 
 
431 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  48.02 
 
 
429 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  45.22 
 
 
429 aa  360  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.49 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  47.32 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.02 
 
 
429 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.98 
 
 
432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  46.4 
 
 
433 aa  353  4e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  7e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.27 
 
 
431 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  43.55 
 
 
433 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  43.32 
 
 
433 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  43.71 
 
 
430 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  43.26 
 
 
429 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.46 
 
 
433 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.79 
 
 
429 aa  350  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.94 
 
 
465 aa  350  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.49 
 
 
429 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.79 
 
 
429 aa  349  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.24 
 
 
436 aa  349  7e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
429 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0666  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.63 
 
 
433 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.79 
 
 
429 aa  345  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.4 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  43.58 
 
 
494 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.42 
 
 
433 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.36 
 
 
442 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  41.42 
 
 
433 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 
429 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.88 
 
 
432 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  42.3 
 
 
449 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.22 
 
 
449 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  42.3 
 
 
449 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  40.93 
 
 
429 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0631  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.17 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000126006  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.05 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.05 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  41.07 
 
 
433 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 
449 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  41.32 
 
 
433 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  41.32 
 
 
433 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  41.32 
 
 
433 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>