More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0392 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  84.71 
 
 
471 aa  720    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  84.93 
 
 
471 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  88.51 
 
 
470 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  84.71 
 
 
471 aa  720    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
470 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  63.29 
 
 
498 aa  541  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.39 
 
 
521 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.92 
 
 
491 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.61 
 
 
486 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  55.74 
 
 
488 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.62 
 
 
479 aa  450  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.07 
 
 
506 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 
481 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.59 
 
 
491 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.59 
 
 
515 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.8 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.21 
 
 
490 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.48 
 
 
480 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.53 
 
 
491 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  49.38 
 
 
494 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  52 
 
 
490 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  47.5 
 
 
487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.88 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  50 
 
 
484 aa  396  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.9 
 
 
488 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.56 
 
 
463 aa  388  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.73 
 
 
483 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.56 
 
 
461 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  45.89 
 
 
493 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  50.43 
 
 
496 aa  372  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.47 
 
 
518 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  45.13 
 
 
502 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.25 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.31 
 
 
480 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.51 
 
 
465 aa  320  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.07 
 
 
456 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.61 
 
 
456 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.6 
 
 
442 aa  300  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.39 
 
 
456 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.93 
 
 
496 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.83 
 
 
460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 
463 aa  283  5.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.99 
 
 
460 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.24 
 
 
466 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.59 
 
 
433 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.47 
 
 
462 aa  266  7e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.67 
 
 
440 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.91 
 
 
441 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.7 
 
 
444 aa  264  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.45 
 
 
441 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.88 
 
 
437 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.92 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.3 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.21 
 
 
457 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.84 
 
 
431 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  38.65 
 
 
430 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0727  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.97 
 
 
458 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.32 
 
 
442 aa  250  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  38.51 
 
 
430 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  35.79 
 
 
430 aa  249  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.85 
 
 
454 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.34 
 
 
438 aa  249  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.41 
 
 
444 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.41 
 
 
444 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.06 
 
 
430 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  35.81 
 
 
429 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1753  xanthine/uracil permease family protein  35.77 
 
 
482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.91 
 
 
465 aa  246  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.33 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.56 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.97 
 
 
429 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.04 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.98 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.22 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.65 
 
 
438 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  35.46 
 
 
429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.81 
 
 
432 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  34.06 
 
 
436 aa  243  7.999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  35.53 
 
 
431 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.06 
 
 
431 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.79 
 
 
453 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.41 
 
 
443 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.99 
 
 
446 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.11 
 
 
431 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.75 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.4 
 
 
445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.22 
 
 
433 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.22 
 
 
433 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 
449 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.92 
 
 
471 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  34.87 
 
 
431 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.62 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  33.62 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  33.62 
 
 
442 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.43 
 
 
433 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.77 
 
 
446 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.22 
 
 
431 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.75 
 
 
429 aa  238  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.11 
 
 
429 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>