More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13510  permease  100 
 
 		 502 aa  968    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 		 517 aa  528  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.95 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  57.43 
 
 		 506 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  60.38 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  58.47 
 
 		 487 aa  505  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.71 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  58.94 
 
 		 484 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.51 
 
 		 518 aa  498  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.76 
 
 		 491 aa  491  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.64 
 
 		 488 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.34 
 
 		 481 aa  465  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.85 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.42 
 
 		 490 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.61 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  49.3 
 
 		 493 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.3 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.69 
 
 		 491 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.43 
 
 		 463 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.31 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.41 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50 
 
 		 475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  50.1 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.17 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.75 
 
 		 498 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.8 
 
 		 461 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  52.58 
 
 		 496 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.94 
 
 		 521 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.31 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.77 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.98 
 
 		 470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.93 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.12 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.11 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.11 
 
 		 471 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.11 
 
 		 471 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.16 
 
 		 496 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.04 
 
 		 456 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.71 
 
 		 440 aa  299  9e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.58 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.79 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.81 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.3 
 
 		 460 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.79 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  36.97 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.54 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.21 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.13 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.13 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.12 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.56 
 
 		 446 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.84 
 
 		 460 aa  276  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.29 
 
 		 442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.27 
 
 		 438 aa  273  7e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.27 
 
 		 463 aa  273  8.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.02 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.66 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  37.58 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.68 
 
 		 454 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.17 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  36.94 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.38 
 
 		 441 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.09 
 
 		 432 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.11 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.17 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.23 
 
 		 443 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.79 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.24 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  37.08 
 
 		 430 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.32 
 
 		 453 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.45 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.7 
 
 		 429 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.52 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.75 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.52 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  36.67 
 
 		 430 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.55 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.67 
 
 		 433 aa  261  3e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.67 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.61 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.19 
 
 		 470 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.4 
 
 		 448 aa  259  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.45 
 
 		 449 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.31 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  33.96 
 
 		 436 aa  259  9e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.4 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  36.4 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.61 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.18 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  36.4 
 
 		 444 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  36.13 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  37.89 
 
 		 428 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.66 
 
 		 466 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.98 
 
 		 452 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.03 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.19 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  36.19 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.56 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.19 
 
 		 444 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>