More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03550 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03550  permease  100 
 
 		 437 aa  853    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.27 
 
 		 438 aa  541  9.999999999999999e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.96 
 
 		 438 aa  468  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.41 
 
 		 465 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.73 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  44.76 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.1 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.7 
 
 		 452 aa  312  5.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  39.91 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.14 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  39.22 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.3 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  39.22 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.11 
 
 		 463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.93 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.04 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.04 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.99 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.99 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.58 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.58 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 433 aa  300  5e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  39.18 
 
 		 430 aa  299  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.39 
 
 		 453 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  39.04 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.98 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.75 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.05 
 
 		 431 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.47 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.2 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 		 441 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.28 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  40.38 
 
 		 494 aa  294  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  38.52 
 
 		 431 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.51 
 
 		 471 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  37.82 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.38 
 
 		 496 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  37.24 
 
 		 453 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.6 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.84 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.93 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  36.61 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  37.59 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.08 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  36.67 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.64 
 
 		 441 aa  289  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.45 
 
 		 491 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.67 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.78 
 
 		 465 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.05 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1665  permease  38.13 
 
 		 464 aa  287  2e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3346  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.56 
 
 		 453 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00813782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.3 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4183  xanthine/uracil/vitamin C permease  41 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.851751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.46 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  38.85 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.47 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1867  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.88 
 
 		 455 aa  286  7e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000230048  hitchhiker  0.00000000132441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.05 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.37 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.09 
 
 		 436 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.37 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.99 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.37 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  36.26 
 
 		 444 aa  285  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  36.83 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.85 
 
 		 429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  37.21 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.01 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.92 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.3 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.21 
 
 		 431 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.78 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.47 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.61 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.57 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.95 
 
 		 517 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  38.71 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.56 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.39 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.71 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.7 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  37.79 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.24 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.03 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  37.84 
 
 		 433 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  37.27 
 
 		 433 aa  279  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>