More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0817 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 507 aa  973    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.4 
 
 		 515 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.13 
 
 		 506 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  57.08 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  58.49 
 
 		 487 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  59.33 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.1 
 
 		 491 aa  498  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.36 
 
 		 491 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  60.17 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.4 
 
 		 517 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.97 
 
 		 480 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.56 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.67 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.78 
 
 		 490 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  54.78 
 
 		 493 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  53.24 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.51 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.75 
 
 		 486 aa  460  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.45 
 
 		 475 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.24 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.92 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.4 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.52 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  52.98 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.48 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.01 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.01 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.01 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.59 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.1 
 
 		 484 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.47 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  54.18 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  50.85 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.98 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.48 
 
 		 460 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.43 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.43 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.93 
 
 		 480 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.13 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.62 
 
 		 463 aa  296  5e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.2 
 
 		 440 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.47 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.92 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.48 
 
 		 442 aa  289  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.36 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.58 
 
 		 433 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.99 
 
 		 444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.56 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.56 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.34 
 
 		 460 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.61 
 
 		 433 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.3 
 
 		 433 aa  280  6e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.92 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.45 
 
 		 452 aa  276  9e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.36 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.03 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.75 
 
 		 441 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.51 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.31 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 		 429 aa  267  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.04 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.19 
 
 		 465 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.85 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.79 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.5 
 
 		 434 aa  259  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.74 
 
 		 454 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.32 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  34.95 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  36.31 
 
 		 436 aa  257  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.94 
 
 		 446 aa  257  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.86 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  35.38 
 
 		 465 aa  256  7e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1019  xanthine/uracil permease family protein  36.89 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  37.8 
 
 		 458 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.37 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.83 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.86 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.93 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.58 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.37 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.6 
 
 		 442 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  35.93 
 
 		 436 aa  253  8.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.23 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.76 
 
 		 443 aa  251  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.36 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.18 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3356  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.09 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000349173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  35.14 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2527  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.16 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1882  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.15 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  37.15 
 
 		 430 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  34.71 
 
 		 429 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.06 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.85 
 
 		 435 aa  246  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.48 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.66 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4526  xanthine/uracil permease family protein  34.72 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.691811  normal  0.190363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>