More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2567 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
461 aa  877    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.06 
 
 
475 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.31 
 
 
483 aa  531  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.27 
 
 
463 aa  500  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.12 
 
 
506 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.72 
 
 
515 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  50.84 
 
 
494 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.92 
 
 
507 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  51.47 
 
 
488 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  49.79 
 
 
487 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.96 
 
 
491 aa  428  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.27 
 
 
480 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.53 
 
 
486 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.16 
 
 
491 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.06 
 
 
498 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.52 
 
 
491 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  49.04 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.41 
 
 
488 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.96 
 
 
521 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  50.31 
 
 
484 aa  413  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.31 
 
 
481 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.16 
 
 
490 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.94 
 
 
490 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  47.9 
 
 
502 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.41 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.01 
 
 
484 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.11 
 
 
479 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.74 
 
 
471 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.04 
 
 
470 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.74 
 
 
471 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.74 
 
 
471 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.21 
 
 
517 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.86 
 
 
518 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.56 
 
 
470 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  49.37 
 
 
496 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.93 
 
 
496 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.68 
 
 
460 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.31 
 
 
465 aa  339  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  44.01 
 
 
456 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.08 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.08 
 
 
456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.08 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.11 
 
 
440 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.36 
 
 
460 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.61 
 
 
463 aa  294  2e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.75 
 
 
433 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.67 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.34 
 
 
466 aa  282  8.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.98 
 
 
457 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.07 
 
 
438 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.47 
 
 
434 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.96 
 
 
445 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.47 
 
 
434 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.53 
 
 
454 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  36.97 
 
 
436 aa  266  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.97 
 
 
441 aa  266  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.24 
 
 
442 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.79 
 
 
453 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.66 
 
 
471 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.81 
 
 
442 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  36.97 
 
 
430 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.43 
 
 
431 aa  264  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  37.81 
 
 
442 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  34.48 
 
 
444 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  37.58 
 
 
442 aa  263  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.36 
 
 
441 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.73 
 
 
436 aa  263  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  36.75 
 
 
429 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  35.08 
 
 
436 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.24 
 
 
452 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.14 
 
 
430 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  37.06 
 
 
436 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  38.19 
 
 
433 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  38.94 
 
 
429 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.19 
 
 
433 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.29 
 
 
451 aa  261  2e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0365  xanthine/uracil permease family protein  35 
 
 
473 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0987606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.69 
 
 
449 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.68 
 
 
441 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  37.14 
 
 
445 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.88 
 
 
431 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.69 
 
 
449 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.08 
 
 
429 aa  259  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  37.14 
 
 
445 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  37.14 
 
 
445 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.62 
 
 
445 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.14 
 
 
445 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.76 
 
 
445 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.41 
 
 
444 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  38.8 
 
 
434 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0281  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.17 
 
 
436 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.75 
 
 
443 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.69 
 
 
449 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0783  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.75 
 
 
431 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  33.41 
 
 
444 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  38.27 
 
 
437 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  38.72 
 
 
429 aa  257  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  35.78 
 
 
470 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.08 
 
 
429 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.69 
 
 
449 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>