More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0240 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  100 
 
 		 493 aa  949    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  61.59 
 
 		 484 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.17 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.47 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  56.36 
 
 		 517 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  52.59 
 
 		 494 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.06 
 
 		 491 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.21 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.22 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.37 
 
 		 481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  53.83 
 
 		 487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  54.34 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.59 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  54.04 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.71 
 
 		 518 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.78 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.73 
 
 		 490 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.05 
 
 		 490 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.4 
 
 		 491 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  50.2 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 		 521 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  50 
 
 		 502 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.15 
 
 		 475 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.8 
 
 		 479 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.28 
 
 		 486 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.04 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.47 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  51.77 
 
 		 496 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.26 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.38 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.11 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.11 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.11 
 
 		 471 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.52 
 
 		 480 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.8 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.45 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  43.58 
 
 		 456 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.19 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.01 
 
 		 460 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.98 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 		 442 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.74 
 
 		 460 aa  290  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.04 
 
 		 438 aa  289  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.93 
 
 		 433 aa  286  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 		 440 aa  281  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.9 
 
 		 441 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  38.33 
 
 		 441 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.97 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.69 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.05 
 
 		 437 aa  276  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  35.55 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.08 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.17 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.17 
 
 		 444 aa  270  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.29 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.88 
 
 		 462 aa  264  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.63 
 
 		 436 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.67 
 
 		 441 aa  263  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.28 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.34 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.96 
 
 		 466 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.64 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.34 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  35.48 
 
 		 429 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.85 
 
 		 433 aa  257  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  35.27 
 
 		 437 aa  257  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  35.99 
 
 		 431 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.65 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  35.48 
 
 		 434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.64 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  36.99 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  35.78 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.21 
 
 		 433 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.48 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  35.65 
 
 		 428 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.27 
 
 		 429 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.21 
 
 		 431 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.58 
 
 		 445 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  36.85 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.39 
 
 		 443 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  35.7 
 
 		 429 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4008  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.66 
 
 		 445 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  35.7 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  36.54 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  36.11 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.12 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  35.9 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.49 
 
 		 457 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0172  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.42 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000522834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  35.9 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  35.9 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.68 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  35.9 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  35.97 
 
 		 429 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  35.9 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  35.62 
 
 		 429 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  36.11 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  34.03 
 
 		 465 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>