More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2715 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1019  xanthine/uracil permease family protein  87.07 
 
 		 433 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  100 
 
 		 436 aa  851    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0540  Xanthine/uracil/vitamin C permease  75.23 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000138914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0553  Xanthine/uracil/vitamin C permease  75.46 
 
 		 436 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000333886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  68.06 
 
 		 433 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3003  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.52 
 
 		 433 aa  591  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  56.68 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.54 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.78 
 
 		 433 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1882  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.92 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1067  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.1 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1494  xanthine/uracil permease family protein  54.76 
 
 		 435 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1074  xanthine/uracil permease family protein  55.22 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.76 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.16 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.88 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 433 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.13 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.65 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.43 
 
 		 440 aa  351  1e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.69 
 
 		 454 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  43.87 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  43.57 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  44.05 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.8 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  45.5 
 
 		 434 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.62 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.56 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.48 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.09 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  43.99 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.84 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.84 
 
 		 441 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.73 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  45.5 
 
 		 433 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.15 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  43.3 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.59 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.91 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.38 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  41.26 
 
 		 429 aa  332  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.78 
 
 		 463 aa  332  9e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  42.33 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.44 
 
 		 431 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  40.56 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  43.2 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.2 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.54 
 
 		 431 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.57 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.63 
 
 		 429 aa  330  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  44.11 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  44.11 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  44.11 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 429 aa  329  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.56 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.56 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.56 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.86 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.56 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.56 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.96 
 
 		 431 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  44.34 
 
 		 433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.74 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  42.76 
 
 		 431 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  43.88 
 
 		 433 aa  326  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.63 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  42.52 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.09 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.46 
 
 		 453 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 		 446 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  41.26 
 
 		 430 aa  322  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 		 446 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.63 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  44.5 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  40.94 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.98 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.76 
 
 		 429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.82 
 
 		 449 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  40.71 
 
 		 449 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.76 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  43.49 
 
 		 430 aa  319  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.44 
 
 		 449 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.97 
 
 		 449 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.2 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.32 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.12 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.42 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.16 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  42.68 
 
 		 465 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>