More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0936 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 
433 aa  847    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.93 
 
 
460 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  52.68 
 
 
429 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.35 
 
 
436 aa  425  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  51.75 
 
 
429 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.82 
 
 
437 aa  415  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  49.42 
 
 
429 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  49.41 
 
 
429 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  49.88 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.12 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  52.33 
 
 
434 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  47.91 
 
 
430 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.42 
 
 
430 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.29 
 
 
433 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.82 
 
 
433 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.44 
 
 
433 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.82 
 
 
433 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  45.45 
 
 
465 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  43.95 
 
 
465 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.22 
 
 
429 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.7 
 
 
433 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.92 
 
 
429 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.35 
 
 
428 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.81 
 
 
431 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  46.85 
 
 
431 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.88 
 
 
440 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.09 
 
 
431 aa  366  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.85 
 
 
431 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  45.54 
 
 
449 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.76 
 
 
429 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.22 
 
 
429 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  46.39 
 
 
431 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.55 
 
 
431 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.32 
 
 
431 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  45.54 
 
 
449 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.13 
 
 
446 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.85 
 
 
431 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.85 
 
 
441 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  46.62 
 
 
431 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.62 
 
 
431 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  44.19 
 
 
429 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.1 
 
 
429 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.22 
 
 
429 aa  363  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
429 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
429 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
429 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.95 
 
 
429 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
429 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1137  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.62 
 
 
431 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.039074  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.71 
 
 
432 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.52 
 
 
429 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.14 
 
 
431 aa  359  5e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.29 
 
 
429 aa  359  6e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.29 
 
 
429 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  43.95 
 
 
429 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.15 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 
449 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.14 
 
 
454 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.82 
 
 
449 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  46.73 
 
 
430 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.77 
 
 
435 aa  352  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.71 
 
 
430 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.36 
 
 
449 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  46.73 
 
 
430 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.77 
 
 
442 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  45.77 
 
 
442 aa  349  7e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  45.77 
 
 
442 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.36 
 
 
449 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.58 
 
 
435 aa  347  3e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.13 
 
 
449 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.62 
 
 
443 aa  345  8.999999999999999e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.35 
 
 
467 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1566  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.46 
 
 
430 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000114361 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.5 
 
 
445 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.84 
 
 
433 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.61 
 
 
443 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.17 
 
 
457 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.07 
 
 
430 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1020  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.11 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.36 
 
 
462 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.61 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2302  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.4 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00748681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  43.66 
 
 
445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  43.66 
 
 
445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  43.66 
 
 
445 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  43.66 
 
 
445 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0341  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.45 
 
 
438 aa  335  7e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1251  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.44 
 
 
465 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000260393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.83 
 
 
441 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  45.79 
 
 
494 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0323  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.21 
 
 
438 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.58 
 
 
471 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1019  xanthine/uracil permease family protein  41.57 
 
 
433 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  43.45 
 
 
428 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  41.03 
 
 
453 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  42.33 
 
 
436 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  44.83 
 
 
441 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  44.83 
 
 
441 aa  331  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  44.83 
 
 
441 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>