More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1032 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1032  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
433 aa  841    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1019  xanthine/uracil permease family protein  69.44 
 
 
433 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0388541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2715  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  68.06 
 
 
436 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3003  xanthine/uracil/vitamin C permease  72.69 
 
 
433 aa  590  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0540  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.12 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000138914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0553  Xanthine/uracil/vitamin C permease  70.12 
 
 
436 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000333886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1698  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.47 
 
 
433 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1589  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.4 
 
 
434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320476  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0847  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58 
 
 
433 aa  501  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0132652  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1882  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.47 
 
 
433 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2295  xanthine/uracil/vitamin C transporter  57.77 
 
 
436 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1067  Xanthine/uracil/vitamin C permease  59.16 
 
 
435 aa  490  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1494  xanthine/uracil permease family protein  57.31 
 
 
435 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1074  xanthine/uracil permease family protein  55.45 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.17 
 
 
433 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.86 
 
 
433 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.86 
 
 
433 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.38 
 
 
433 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.47 
 
 
430 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.27 
 
 
434 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  45 
 
 
460 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.87 
 
 
433 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.99 
 
 
442 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.27 
 
 
434 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.55 
 
 
436 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  46.06 
 
 
429 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  45.33 
 
 
429 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.68 
 
 
431 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  44.99 
 
 
430 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.74 
 
 
441 aa  360  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.48 
 
 
453 aa  359  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.45 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.92 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.45 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.45 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.45 
 
 
431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.6 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.39 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  46.45 
 
 
431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  45.22 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.2 
 
 
446 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.78 
 
 
433 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  45.33 
 
 
430 aa  355  8.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.88 
 
 
433 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1547  permease  44.99 
 
 
429 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198208  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  45.97 
 
 
431 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.26 
 
 
431 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  46.65 
 
 
434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1078  NCS2 family nucleobase/cation symporter  47.64 
 
 
433 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234361  normal  0.0267352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  45.73 
 
 
431 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1565  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.87 
 
 
431 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109855 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.5 
 
 
440 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.39 
 
 
429 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  46.6 
 
 
430 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.13 
 
 
446 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.84 
 
 
430 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2756  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.09 
 
 
446 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.759738  normal  0.128218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.13 
 
 
446 aa  347  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.36 
 
 
449 aa  346  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.73 
 
 
431 aa  346  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  46.48 
 
 
430 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0936  xanthine/uracil permease family protein  44.84 
 
 
433 aa  344  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0512099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44800  putative transporter  44.16 
 
 
449 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  47.1 
 
 
453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.22 
 
 
429 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  46.87 
 
 
453 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.6 
 
 
429 aa  342  5e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.22 
 
 
429 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4656  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.9 
 
 
446 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.28 
 
 
432 aa  341  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4284  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.59 
 
 
449 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.773076  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.96 
 
 
432 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3848  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.36 
 
 
449 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.512754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.63 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1584  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.36 
 
 
449 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3815  putative transporter  43.69 
 
 
449 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231468  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.43 
 
 
433 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.43 
 
 
433 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0806  AzgA family purine transporter  45.75 
 
 
433 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2164  permease  45.75 
 
 
433 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0897  AzgA family purine transporter  45.75 
 
 
433 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  45.2 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  42.86 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  45.99 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2004  xanthine/uracil permease family protein  44.62 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.461655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1722  permease  45.03 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.644208  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.86 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  42.86 
 
 
442 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.76 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.2 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3610  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.482914  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.25 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1711  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.59 
 
 
449 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0841088  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.01 
 
 
430 aa  335  7e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07810  Xanthine/uracil/vitamin C permease family  47.89 
 
 
494 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  40.42 
 
 
436 aa  334  2e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.71 
 
 
463 aa  334  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.5 
 
 
433 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.5 
 
 
433 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.5 
 
 
433 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>