41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2270 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2270  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.674256  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  37.2 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  29.63 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  32.94 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  31.01 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  28.95 
 
 
202 aa  57.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  27.38 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  30.15 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  30.99 
 
 
207 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  29.19 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  27.95 
 
 
184 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  28.04 
 
 
193 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  30.36 
 
 
188 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  29.52 
 
 
189 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  30.54 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  30.95 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  34.82 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22230  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  25.45 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  24.85 
 
 
167 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  24.85 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0334  hypothetical protein  24.88 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  28.31 
 
 
191 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  30.12 
 
 
185 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  25.86 
 
 
196 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  27.68 
 
 
226 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5427  hypothetical protein  30.28 
 
 
198 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0444  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00202884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0434  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1453  hypothetical protein  29.48 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.313622  normal  0.465473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  27.19 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0421  hypothetical protein  35.71 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2465  hypothetical protein  29.46 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00930954  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  29.41 
 
 
220 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  26.38 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  28.99 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  26.13 
 
 
197 aa  42  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  28.99 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8890  hypothetical protein  29.84 
 
 
199 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  27.91 
 
 
194 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>