More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5746 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
256 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4267  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.728636  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.86 
 
 
260 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.92 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.39 
 
 
267 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.23 
 
 
260 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  40.93 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2036  enoyl-CoA hydratase  42.41 
 
 
257 aa  178  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.189819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.77 
 
 
263 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
259 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.46 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
260 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.3 
 
 
661 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
260 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.44 
 
 
258 aa  175  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.46 
 
 
662 aa  175  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4681  enoyl-CoA hydratase  42.02 
 
 
260 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.7 
 
 
271 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.02 
 
 
274 aa  175  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0633  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.31 
 
 
258 aa  175  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2212  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136101  normal  0.0104789 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2628  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.24 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.55 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  41.15 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  38.96 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.74 
 
 
260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  38.13 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
260 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3055  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.92 
 
 
260 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1709  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.04 
 
 
261 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  37.75 
 
 
262 aa  171  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4387  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4231  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4156  enoyl-CoA hydratase  41.25 
 
 
257 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.08 
 
 
662 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  37.3 
 
 
663 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  40.64 
 
 
258 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.02 
 
 
260 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  43.7 
 
 
260 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  37.15 
 
 
260 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.9 
 
 
269 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1174  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.08 
 
 
258 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.04859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.28 
 
 
257 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  38.31 
 
 
258 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
255 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  37.55 
 
 
275 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.18 
 
 
260 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.82 
 
 
260 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
257 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.89 
 
 
257 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  39.52 
 
 
258 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.57 
 
 
258 aa  166  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00100177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3005  short chain enoyl-CoA hydratase  41.47 
 
 
259 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
259 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_55192  hydratase enyol-coa hydratase  38.4 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.43 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.2 
 
 
258 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4306  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.25 
 
 
258 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  39.6 
 
 
262 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
258 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  38.08 
 
 
258 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.58 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  35.83 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.86 
 
 
257 aa  164  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.07 
 
 
259 aa  164  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 
269 aa  164  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1558  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0655  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.52 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2662  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0597  short chain enoyl-CoA hydratase  40.91 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00392493  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  37.8 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1716  short chain enoyl-CoA hydratase  39.3 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.923335  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  39.53 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  39.67 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.78 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.02 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43440  enoyl-CoA hydratase  40.33 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2213  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
257 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0591948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2252  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
259 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.31 
 
 
265 aa  163  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2301  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.83 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  42.08 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.46 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.43 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3481  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
266 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>