32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4862 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4862  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  265  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711922  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1830  hypothetical protein  75.83 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  69.11 
 
 		 129 aa  183  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  65.32 
 
 		 131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  55.12 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4362  protein of unknown function DUF1486  58.33 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.364126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3849  protein of unknown function DUF1486  57.26 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0684  putative taurine dehydrogenase, small subunit  58.33 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1644  hypothetical protein  57.02 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.25271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1992  hypothetical protein  55.83 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209953  normal  0.907507 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6225  hypothetical protein  55.83 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4515  hypothetical protein  57.27 
 
 		 134 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.275606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0117  protein of unknown function DUF1486  53.72 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2020  hypothetical protein  53.33 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  55.86 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0138  hypothetical protein  53.33 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3751  hypothetical protein  52.94 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4758  hypothetical protein  51.72 
 
 		 132 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3154  hypothetical protein  47.06 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  27.43 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1039  protein of unknown function DUF1486  29.6 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1405  protein of unknown function DUF1486  28.97 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0723  hypothetical protein  29.06 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00486014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  29.82 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4443  hypothetical protein  29.06 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.253642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5664  protein of unknown function DUF1486  28.45 
 
 		 257 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5586  protein of unknown function DUF1486  33.64 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1031  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.95008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1179  protein of unknown function DUF1486  26.23 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  26.5 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0619  hypothetical protein  27.2 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4572  protein of unknown function DUF1486  26.09 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>