More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2367 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  82.44 
 
 		 483 aa  842    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_004310  BR0278  phenylhydantoinase  74.16 
 
 		 489 aa  756    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  89.05 
 
 		 484 aa  924    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  80.79 
 
 		 483 aa  833    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0183  phenylhydantoinase  80.79 
 
 		 501 aa  837    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.278441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2705  phenylhydantoinase  69.28 
 
 		 487 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.291831  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3457  phenylhydantoinase  85.33 
 
 		 484 aa  891    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  80.58 
 
 		 484 aa  842    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2664  phenylhydantoinase  73.49 
 
 		 485 aa  723    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  100 
 
 		 484 aa  1008    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  89.26 
 
 		 484 aa  923    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0347  phenylhydantoinase  74.21 
 
 		 484 aa  762    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  71.49 
 
 		 489 aa  737    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  66.46 
 
 		 485 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  80.79 
 
 		 483 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0292  phenylhydantoinase  74.16 
 
 		 489 aa  756    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4055  phenylhydantoinase  55.86 
 
 		 480 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3441  phenylhydantoinase  55.74 
 
 		 479 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546969  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  54.49 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2687  phenylhydantoinase  54.45 
 
 		 483 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1431  phenylhydantoinase  54.45 
 
 		 483 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.985179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  54.49 
 
 		 479 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  54.7 
 
 		 496 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6658  phenylhydantoinase  53.61 
 
 		 485 aa  542  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351281  normal  0.0552817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5719  phenylhydantoinase  53.81 
 
 		 485 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.376698 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6714  phenylhydantoinase  53.81 
 
 		 485 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5963  phenylhydantoinase  53.81 
 
 		 485 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417247  normal  0.398194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  53.65 
 
 		 479 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5353  phenylhydantoinase  53.31 
 
 		 485 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.160093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1532  phenylhydantoinase  52.8 
 
 		 483 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1593  phenylhydantoinase  53.61 
 
 		 485 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514633  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6238  phenylhydantoinase  53.61 
 
 		 485 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.602815  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  53.44 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  52.61 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2182  dihydropyrimidinase  52.58 
 
 		 478 aa  531  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.140965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4250  phenylhydantoinase  53.49 
 
 		 473 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  54.51 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0227  phenylhydantoinase  55.39 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0770073  normal  0.255137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2864  phenylhydantoinase  51.04 
 
 		 486 aa  505  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0969  phenylhydantoinase  51.76 
 
 		 486 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4149  phenylhydantoinase  51.04 
 
 		 483 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  48.7 
 
 		 472 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  47.37 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  47.83 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  43.01 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  42.58 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  44.52 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  43.7 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  42.17 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  41.88 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  41.88 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  43.72 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  41.88 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  42.06 
 
 		 471 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4267  phenylhydantoinase  42.03 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.475429  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5731  phenylhydantoinase  41.44 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1432  dihydropyrimidinase  40.26 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.897343  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  41.25 
 
 		 474 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2578  phenylhydantoinase  40.68 
 
 		 478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  40.7 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0839  dihydropyrimidinase  39.61 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  40.61 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0819  dihydropyrimidinase  40.26 
 
 		 461 aa  329  7e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  40.26 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  40.26 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  40.26 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  40.26 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  40.26 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  40.26 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  40.04 
 
 		 461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0430  dihydropyrimidinase  41.23 
 
 		 461 aa  323  6e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  39.65 
 
 		 479 aa  320  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  40 
 
 		 466 aa  319  9e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  37.83 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4277  phenylhydantoinase  39.7 
 
 		 475 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  39.35 
 
 		 479 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  39.39 
 
 		 472 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0551  phenylhydantoinase  38.6 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  38.7 
 
 		 467 aa  306  7e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  39.12 
 
 		 454 aa  305  9.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  39.04 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  38.16 
 
 		 471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  38.41 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  38.23 
 
 		 473 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  37.09 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  37.09 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  39.01 
 
 		 475 aa  295  8e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  36.52 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0244  dihydropyrimidinase  36.76 
 
 		 451 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.20857  normal  0.276303 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  36.3 
 
 		 485 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  36.09 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1430  dihydropyrimidinase  35.73 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  40 
 
 		 467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  36.12 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  35.08 
 
 		 477 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2960  dihydropyrimidinase  34.56 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  36.84 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2543  dihydropyrimidinase  37.34 
 
 		 503 aa  280  4e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.65839  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  34.7 
 
 		 489 aa  269  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  35.19 
 
 		 474 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>