More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0749 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1085    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  52.76 
 
 		 545 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  54.11 
 
 		 545 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  55.11 
 
 		 545 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  54.93 
 
 		 545 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  57.51 
 
 		 564 aa  522  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  49.36 
 
 		 580 aa  520  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  54.53 
 
 		 545 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  54.8 
 
 		 544 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  55.16 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  54.97 
 
 		 533 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  53.02 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  51.14 
 
 		 537 aa  478  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  49.44 
 
 		 530 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  49.81 
 
 		 545 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  50.5 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  45.2 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  45.94 
 
 		 535 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  45.56 
 
 		 535 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  46.89 
 
 		 536 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  45.69 
 
 		 559 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.94 
 
 		 554 aa  314  2.9999999999999996e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  40.08 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.58 
 
 		 534 aa  289  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  38.66 
 
 		 541 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  43.07 
 
 		 536 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  34.4 
 
 		 541 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  35.37 
 
 		 541 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  34.02 
 
 		 541 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  35.47 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  34.33 
 
 		 558 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.53 
 
 		 557 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  34.4 
 
 		 547 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  32.02 
 
 		 562 aa  227  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  34.4 
 
 		 605 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.8 
 
 		 566 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.53 
 
 		 554 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  31.03 
 
 		 566 aa  224  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  31.95 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.56 
 
 		 569 aa  223  6e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  31.95 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  31.95 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  31.95 
 
 		 562 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  31.95 
 
 		 562 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.01 
 
 		 556 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  31.76 
 
 		 562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  33.27 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.59 
 
 		 569 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  31.57 
 
 		 562 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  32.87 
 
 		 553 aa  220  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  31.57 
 
 		 562 aa  220  6e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.03 
 
 		 555 aa  220  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  31.57 
 
 		 562 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.57 
 
 		 562 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  31.57 
 
 		 562 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  31.84 
 
 		 562 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.97 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  31.45 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  31.45 
 
 		 562 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  31.69 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  31.58 
 
 		 623 aa  217  4e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  33.46 
 
 		 564 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  32.58 
 
 		 569 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31 
 
 		 563 aa  216  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 		 564 aa  216  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.95 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  32.35 
 
 		 560 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.48 
 
 		 554 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.26 
 
 		 588 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  31.68 
 
 		 578 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.74 
 
 		 548 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.14 
 
 		 558 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  32.28 
 
 		 554 aa  213  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.1 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.54 
 
 		 597 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.75 
 
 		 573 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  32.71 
 
 		 554 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.46 
 
 		 597 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.91 
 
 		 629 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.57 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.39 
 
 		 548 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.77 
 
 		 588 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  31.37 
 
 		 578 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.12 
 
 		 586 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.66 
 
 		 553 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.85 
 
 		 573 aa  210  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.85 
 
 		 565 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.27 
 
 		 552 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.15 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  33.03 
 
 		 590 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  32.77 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.35 
 
 		 618 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.01 
 
 		 574 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  31.15 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  32.71 
 
 		 554 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.72 
 
 		 627 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.48 
 
 		 562 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.01 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.01 
 
 		 623 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.89 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>