58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3360 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3360  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 
391 aa  790    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0256  phosphate-selective porin O and P  59.02 
 
 
398 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.893691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0285  porin O precursor  58.67 
 
 
398 aa  461  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02409  porin O  59.23 
 
 
397 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1267  phosphate-selective porin O and P  32.14 
 
 
414 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0395  phosphate-selective porin O and P  32.09 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2553  polyphosphate-selective porin O  33.07 
 
 
389 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0898  phosphate-selective porin O and P  31.37 
 
 
499 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2678  phosphate-selective porin O and P  29.55 
 
 
559 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.176893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3436  phosphate-selective porin O and P  27.97 
 
 
426 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0872  phosphate-selective porin O and P  28.86 
 
 
426 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0924  phosphate-selective porin O and P  27.97 
 
 
427 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.541635  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3100  phosphate-selective porin O and P  28.61 
 
 
426 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0048  phosphate-selective porin O and P  31.05 
 
 
465 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.815499  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0934  phosphate-selective porin O and P  28.47 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.909004  normal  0.167999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0900  phosphate-selective porin O and P  28.47 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2076  phosphate-selective porin O and P  29.68 
 
 
470 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000194025  unclonable  2.9237100000000004e-24 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0293  polyphosphate-selective porin O  28.74 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3354  phosphate-selective porin O and P  29.34 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2060  phosphate-selective porin O and P  30.05 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3657  phosphate-selective porin O and P  27.63 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203076  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0263  phosphate-selective porin O and P  29.68 
 
 
389 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1248  phosphate-selective porin O and P  28.43 
 
 
437 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.362976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1555  phosphate-selective porin O and P  31.67 
 
 
291 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0381796  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3943  phosphate-selective porin O and P  27.53 
 
 
442 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.117922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3950  phosphate-selective porin O and P  27.58 
 
 
446 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00821773  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0367  phosphate-selective porin O and P  29.46 
 
 
450 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2417  phosphate-selective porin O and P  28.99 
 
 
464 aa  86.3  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0532  phosphate-selective porin O and P  31.25 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.840384  normal  0.792252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2418  phosphate-selective porin O and P  29.39 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0051  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0037  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0054  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289636  normal  0.0466968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0051  phosphate-selective porin O and P  25.83 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000092284 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02397  polyphosphate-selective porin O  29.82 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3882  phosphate-selective porin O and P  28.57 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21610  pyrophosphate-specific outer membrane porin OprO precursor  27.75 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00788  polyphosphate-selective porin O  27.57 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0157998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4058  phosphate-selective porin O and P  28.06 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0262  phosphate-selective porin O and P  28.89 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1841  outer membrane porin OprO precursor  26.25 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2672  phosphate-selective porin O and P  28.26 
 
 
479 aa  77  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1204  phosphate-selective porin O and P  27.25 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1842  outer membrane porin OprP precursor  24.88 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4086  phosphate-selective porin O and P  29.17 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0301596 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1166  phosphate-selective porin O and P  25.32 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119843  normal  0.257698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21620  phosphate-specific outer membrane porin OprP precursor  25.06 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3882  phosphate-selective porin O and P  21.57 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2230  phosphate-selective porin O and P  26.58 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1431  phosphate-selective porin O and P  26.37 
 
 
453 aa  62.8  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.170062  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0691  phosphate-selective porin O and P  22.12 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3355  phosphate-selective porin O and P  26.47 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.277566  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4553  phosphate-selective porin O and P  26.76 
 
 
481 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354603  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0266  hypothetical protein  23.88 
 
 
575 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3313  phosphate-selective porin O and P  25 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000918115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0811  phosphate-selective porin O and P  35.14 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1375  hypothetical protein  30.51 
 
 
610 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  31.36 
 
 
1346 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>