41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2989 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2989  protein of unknown function DUF819  100 
 
 
416 aa  819    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0559265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1092  protein of unknown function DUF819  69.59 
 
 
414 aa  555  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3451  hypothetical protein  50.12 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3541  protein of unknown function DUF819  50.12 
 
 
415 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3732  hypothetical protein  49.88 
 
 
415 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3609  hypothetical protein  50.12 
 
 
415 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0808  hypothetical protein  49.76 
 
 
415 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0702  hypothetical protein  50.12 
 
 
415 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3828  hypothetical protein  49.39 
 
 
415 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3675  hypothetical protein  49.64 
 
 
417 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.206706  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0774  hypothetical protein  49.64 
 
 
415 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0727  hypothetical protein  49.03 
 
 
415 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534382  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0802  hypothetical protein  49.64 
 
 
415 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3164  hypothetical protein  49.64 
 
 
415 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3122  hypothetical protein  49.52 
 
 
422 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2905  hypothetical protein  50.24 
 
 
425 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0924  hypothetical protein  49.39 
 
 
415 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0116902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2562  hypothetical protein  49.4 
 
 
412 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06021  hypothetical protein  47.32 
 
 
448 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3548  hypothetical protein  45.7 
 
 
420 aa  342  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0015  protein of unknown function DUF819  45.32 
 
 
430 aa  338  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07490  hypothetical protein  46.15 
 
 
419 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1158  hypothetical protein  43.89 
 
 
419 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1378  hypothetical protein  42.39 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.896074  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1083  hypothetical protein  42.14 
 
 
414 aa  327  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.456212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0472  hypothetical protein  46.21 
 
 
422 aa  322  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0361578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2688  protein of unknown function DUF819  43.2 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  0.317958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3158  protein of unknown function DUF819  43.62 
 
 
397 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548354  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2589  hypothetical protein  38.08 
 
 
410 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0813  hypothetical protein  30 
 
 
408 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0732  protein of unknown function DUF819  36.19 
 
 
387 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3170  protein of unknown function DUF819  30.3 
 
 
387 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2418  protein of unknown function DUF819  33.08 
 
 
386 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1799  protein of unknown function DUF819  32.65 
 
 
386 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0833074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4172  hypothetical protein  29.74 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000960733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03940  predicted integral membrane protein  29.97 
 
 
383 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1788  hypothetical protein  27.81 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4083  protein of unknown function DUF819  23.41 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10800  predicted protein  24.71 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.929663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1701  protein of unknown function DUF819  23.96 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1819  hypothetical protein  26.02 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.729925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>