More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1984 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  57.5 
 
 
165 aa  201  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  57.41 
 
 
165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.25 
 
 
165 aa  198  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  56.88 
 
 
165 aa  197  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  57.86 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  57.14 
 
 
162 aa  195  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0618  protein tyrosine phosphatase  54.12 
 
 
175 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2540  protein tyrosine phosphatase  51.16 
 
 
179 aa  192  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.232269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0331  protein tyrosine phosphatase  53.46 
 
 
170 aa  192  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.481618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  54.78 
 
 
165 aa  192  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3124  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.94 
 
 
180 aa  192  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.641523  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  55.7 
 
 
164 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.62 
 
 
175 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.35 
 
 
164 aa  190  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3200  protein tyrosine phosphatase  52.1 
 
 
182 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4199  protein tyrosine phosphatase  54.09 
 
 
169 aa  189  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.56112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  56.21 
 
 
175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5722  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.47 
 
 
175 aa  188  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5682  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  56.47 
 
 
175 aa  188  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0207  protein tyrosine phosphatase  52.83 
 
 
173 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.538928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  55.06 
 
 
179 aa  187  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0875  protein tyrosine phosphatase  55.06 
 
 
189 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
291 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5377  protein tyrosine phosphatase  53.46 
 
 
173 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.75 
 
 
164 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  54.09 
 
 
164 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0325  protein tyrosine phosphatase  51.76 
 
 
175 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  55.21 
 
 
175 aa  184  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  52.2 
 
 
164 aa  184  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2415  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  51.16 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.214614 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3341  arsenate reductase  51.48 
 
 
317 aa  181  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2588  protein tyrosine phosphatase  56.88 
 
 
167 aa  180  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.570758  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  53.46 
 
 
164 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  50.62 
 
 
175 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5674  protein tyrosine phosphatase  53.12 
 
 
164 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4073  protein tyrosine phosphatase  51.18 
 
 
175 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  51.9 
 
 
171 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3419  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 
175 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  51.59 
 
 
298 aa  177  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5056  protein tyrosine phosphatase  50.94 
 
 
175 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2216  protein tyrosine phosphatase  55.62 
 
 
166 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.415752  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1787  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 
179 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  51.19 
 
 
176 aa  174  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  45.98 
 
 
295 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0216  protein tyrosine phosphatase  48.75 
 
 
178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
317 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1344  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  53.8 
 
 
165 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.230877  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6165  protein tyrosine phosphatase  52.83 
 
 
164 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.237527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2516  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 
165 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1579  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 
159 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2640  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.44 
 
 
168 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.261916  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4381  protein tyrosine phosphatase  53.05 
 
 
171 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0699  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.2 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  46.88 
 
 
270 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  48.73 
 
 
287 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0653  protein tyrosine phosphatase  54.35 
 
 
168 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.448039  normal  0.447799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3466  protein tyrosine phosphatase  49.38 
 
 
168 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  45.57 
 
 
270 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.5 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  46.5 
 
 
167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5346  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.2 
 
 
164 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.524005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3255  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.77 
 
 
172 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5600  protein tyrosine phosphatase  48.45 
 
 
164 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123028  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
276 aa  148  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  43.67 
 
 
174 aa  148  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3579  protein tyrosine phosphatase  48.05 
 
 
164 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.747703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1820  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.102898 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5673  protein tyrosine phosphatase  48.7 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5765  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 
164 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6329  protein tyrosine phosphatase  47.2 
 
 
164 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720558  normal  0.0816451 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6164  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 
164 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.398136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5147  protein tyrosine phosphatase  48.1 
 
 
156 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4215  protein tyrosine phosphatase  49.02 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1594  protein tyrosine phosphatase  48.89 
 
 
167 aa  143  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  46.45 
 
 
164 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 
168 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2966  protein tyrosine phosphatase  40.25 
 
 
165 aa  140  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.770903 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2337  protein tyrosine phosphatase  49.37 
 
 
167 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  46.5 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2398  protein tyrosine phosphatase  48.37 
 
 
156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5708  protein tyrosine phosphatase  48.37 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  46.54 
 
 
158 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1532  transcriptional regulator, ArsR family  42.51 
 
 
306 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.94 
 
 
156 aa  138  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4965  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3195  protein tyrosine phosphatase  49.67 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0959  arsenate reductase  47.71 
 
 
164 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  46.54 
 
 
158 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
309 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  44.38 
 
 
284 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4667  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4774  protein tyrosine phosphatase  41.25 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2141  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.28 
 
 
159 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3079  protein tyrosine phosphatase  44.3 
 
 
156 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0583142  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1942  arsenate reductase ArsC  46.41 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0456  arsenate reductase  46.41 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0913  arsenate reductase  46.41 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.910789  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1882  arsenate reductase  46.41 
 
 
164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>