More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1505 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1505  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
269 aa  534  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0164576  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00132  phosphomethylpyrimidine kinase  73.61 
 
 
269 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1619  phosphomethylpyrimidine kinase  66.15 
 
 
269 aa  353  1e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.123369  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1688  phosphomethylpyrimidine kinase  65.37 
 
 
269 aa  347  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.268945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
264 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  44.58 
 
 
264 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  52.07 
 
 
266 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.4 
 
 
271 aa  211  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  45.75 
 
 
267 aa  207  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  42.52 
 
 
270 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  51.04 
 
 
285 aa  204  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  51.05 
 
 
268 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.58 
 
 
288 aa  201  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.58 
 
 
288 aa  201  8e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.06 
 
 
268 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  48.21 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  48.79 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1140  phosphomethylpyrimidine kinase  45.68 
 
 
257 aa  199  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  49.8 
 
 
270 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  42.53 
 
 
263 aa  199  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  44.78 
 
 
510 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  50.63 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  53.12 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  45.67 
 
 
266 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  50.63 
 
 
268 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  42.74 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
270 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  49.59 
 
 
267 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.33 
 
 
270 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  43.95 
 
 
262 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  46.4 
 
 
273 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  46.5 
 
 
270 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  46.89 
 
 
270 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  41.8 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  46.53 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  48.37 
 
 
288 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  53.92 
 
 
274 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  52.77 
 
 
283 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  45.02 
 
 
260 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  52.77 
 
 
308 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  50.83 
 
 
269 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  42.63 
 
 
265 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.75 
 
 
264 aa  185  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  42.7 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  50.83 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  50.83 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  50.61 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  52.17 
 
 
518 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 
264 aa  183  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  52.27 
 
 
531 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  46.34 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  48.39 
 
 
285 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  50.67 
 
 
499 aa  181  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  48.41 
 
 
490 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 
266 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  45.38 
 
 
284 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3765  phosphomethylpyrimidine kinase  44.36 
 
 
278 aa  180  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0235015 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  44.31 
 
 
277 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  51 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  51.21 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1782  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  40.57 
 
 
278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000968277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
269 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  41.42 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
270 aa  178  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  39.54 
 
 
270 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  43.44 
 
 
266 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
268 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
264 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  41.46 
 
 
260 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2688  phosphomethylpyrimidine kinase  46.07 
 
 
275 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  42.68 
 
 
264 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  49.2 
 
 
271 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  50.4 
 
 
268 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  45.85 
 
 
280 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 
267 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  46.1 
 
 
265 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04031  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
262 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.278475  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  49.11 
 
 
285 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  44.02 
 
 
273 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1155  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
272 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.172529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  44.9 
 
 
268 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  50.62 
 
 
269 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  39.92 
 
 
270 aa  175  6e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  50.62 
 
 
269 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  49.37 
 
 
267 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  40.33 
 
 
262 aa  175  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  40.33 
 
 
270 aa  175  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  45.87 
 
 
266 aa  175  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>