40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5211 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  35.86 
 
 		 346 aa  219  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  37.38 
 
 		 350 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  32.65 
 
 		 342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  30.82 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  27.69 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3687  hypothetical protein  33.09 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.212304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  29.27 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  27.3 
 
 		 349 aa  97.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1578  hypothetical protein  28.17 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.07 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  25.26 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  25.69 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  25.42 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  24.83 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  26.52 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  24.68 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  24.31 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  25.98 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  23.78 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  24.11 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  36.7 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25.08 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.75 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25.32 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  29.21 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  20.77 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  30.92 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  30.77 
 
 		 346 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  26 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  25.56 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  31.71 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  26.76 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  27.34 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  34.91 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  31.01 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  38.55 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 		 586 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  24.14 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>