More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4369 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4369  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
416 aa  863    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00420943  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2727  glycosyltransferase-like protein  35.11 
 
 
385 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.838383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.42 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1107  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
669 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3917  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.75 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.75 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0444  putative exopolysaccharide biosynthesis protein EpsF  21.99 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  22.53 
 
 
365 aa  64.3  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
392 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  34.17 
 
 
735 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  25.47 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.02 
 
 
369 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
398 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  21.76 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
457 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
678 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  23.08 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  24.7 
 
 
709 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.59 
 
 
471 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  24.83 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
380 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
420 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
378 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
383 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  24 
 
 
367 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
394 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4436  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
381 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  30.06 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.78 
 
 
459 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  32.73 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.78 
 
 
462 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
381 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  22.4 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  22.4 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 
371 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  22.4 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.43 
 
 
385 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  21.71 
 
 
365 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.91 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  19.43 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.55 
 
 
440 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  32.11 
 
 
1232 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  36.36 
 
 
354 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  36.36 
 
 
354 aa  57.4  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  29.85 
 
 
343 aa  57.4  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  33.33 
 
 
458 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  43.59 
 
 
372 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  32.74 
 
 
365 aa  57  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
401 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  19.59 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
369 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
386 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
360 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  26.52 
 
 
374 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.4 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
463 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  25.64 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
415 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
386 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>