More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0444 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0444  putative exopolysaccharide biosynthesis protein EpsF  100 
 
 
382 aa  787    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
639 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.2 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  27.01 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  26.89 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  25.8 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
463 aa  64.7  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
381 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
382 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  21.87 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  24.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  24.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  24.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
381 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  24.12 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  24.12 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
424 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 
384 aa  63.2  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.91 
 
 
372 aa  63.2  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
389 aa  63.2  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
440 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
505 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
388 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.86 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
369 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 
378 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 
381 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 
373 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  21.07 
 
 
450 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  23.45 
 
 
377 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  24.14 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 
381 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
394 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  25.93 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  25 
 
 
403 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
366 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
415 aa  60.1  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
380 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  24.01 
 
 
377 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.1 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
366 aa  60.1  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
422 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
410 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  26.19 
 
 
390 aa  59.7  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  27.84 
 
 
496 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  21.54 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  29.41 
 
 
471 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
468 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  27.84 
 
 
496 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1082  putative glycosyltransferase  23.6 
 
 
366 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
406 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  25.87 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  23.9 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
342 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  21.79 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  24.37 
 
 
373 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>