100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3968 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  100 
 
 		 406 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  66.42 
 
 		 407 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  65.52 
 
 		 406 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  56.72 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  33.5 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  31.27 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.87 
 
 		 398 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  32.39 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  31.36 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  31.05 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  29.97 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  29.01 
 
 		 411 aa  136  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  31.96 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.49 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.38 
 
 		 367 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  31.67 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  31.67 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.09 
 
 		 367 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.09 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.38 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  31.38 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  31.38 
 
 		 367 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.98 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.33 
 
 		 372 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  28.5 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  28.23 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  27.7 
 
 		 372 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.74 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  28.74 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  27.44 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  27.44 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  27.44 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  29.37 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  24.46 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.39 
 
 		 369 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.39 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.93 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.81 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.6 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  25.81 
 
 		 369 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  26.1 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  25.08 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  26.27 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3766  selenocysteine synthase  27.44 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0042  selenocysteine synthase  27.44 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2477  selenocysteine synthase  26.29 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4115  selenocysteine synthase  27.44 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0090  selenocysteine synthase  28.1 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  21.94 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  24.16 
 
 		 475 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3879  selenocysteine synthase  23.27 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.797755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  23.03 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4521  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  29.61 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3919  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3796  selenocysteine synthase  27.82 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4089  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4962  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.922888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03397  hypothetical protein  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0117  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03446  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4006  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3796  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.915143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0122  selenocysteine synthase  27.95 
 
 		 463 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.74 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  24.64 
 
 		 495 aa  49.7  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  22.73 
 
 		 479 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  25.74 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  21.88 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  22.73 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  25 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1311  selenocysteine synthase  26.17 
 
 		 506 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000207864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0061  selenocysteine synthase  27.97 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3477  L-seryl-tRNA selenium transferase  23.16 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.213454  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  25.93 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  23.61 
 
 		 462 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3060  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  23.73 
 
 		 491 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000814567  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  25.16 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  25.56 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  27.27 
 
 		 489 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  26.03 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  25.35 
 
 		 479 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  25.35 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  23.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.19 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  23.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  23.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  23.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  20.52 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  23.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  23.31 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4068  selenocysteine synthase  24.84 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3897  selenocysteine synthase  24.84 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3883  selenocysteine synthase  24.84 
 
 		 463 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3961  selenocysteine synthase  24.84 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.498417  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4006  selenocysteine synthase  24.84 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.247282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0812  L-seryl-tRNA selenium transferase  22.61 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2039  aminotransferase class V  23.08 
 
 		 460 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  21.48 
 
 		 471 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2096  selenocysteine synthase  25.55 
 
 		 479 aa  43.1  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  20.98 
 
 		 476 aa  43.1  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>