48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3819 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3819  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  51.89 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3702  hypothetical protein  50.96 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180279  unclonable  0.0000000000000038565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0876  hypothetical protein  46.6 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2117  hypothetical protein  45.63 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0855  hypothetical protein  43.61 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  33.98 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  36.11 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  40.38 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  34.95 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  36.45 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  34.62 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  32.69 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  36.94 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0873  hypothetical protein  35.71 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  35.87 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  27.18 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1540  hypothetical protein  38.96 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.110674  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  37.61 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  30.43 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1140  hypothetical protein  30.84 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272267  normal  0.0148221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  29.13 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  36.21 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  28.85 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  28.85 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  28.21 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  28.79 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  22.86 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4212  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  33.04 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  24.8 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2752  hypothetical protein  34.74 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  30.93 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  25.96 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  33.72 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  26.25 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2856  hypothetical protein  27 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  27.78 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  29.9 
 
 		 145 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>