48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3379 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  100 
 
 		 906 aa  1865    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0309  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.84 
 
 		 874 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.440571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7040  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.49 
 
 		 910 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.213605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3990  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.12 
 
 		 942 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7038  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 		 923 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2650  hypothetical protein  29.74 
 
 		 931 aa  324  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  28.62 
 
 		 923 aa  280  8e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0971  hypothetical protein  37.37 
 
 		 932 aa  258  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358184  normal  0.0187365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3266  hypothetical protein  26.82 
 
 		 983 aa  251  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.348309  normal  0.462264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1827  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.97 
 
 		 911 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000101368  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2633  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.07 
 
 		 887 aa  121  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.181298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0158  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.06 
 
 		 848 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12943  Secreted protein containing N-terminal Zinc-dependentcarboxypeptidase related domain  24.85 
 
 		 836 aa  108  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4232  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.94 
 
 		 852 aa  101  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1327  zinc-dependent carboxypeptidase domain-containing protein  22.86 
 
 		 871 aa  97.4  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.571741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0219  hypothetical protein  23.31 
 
 		 858 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.06 
 
 		 862 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  21.34 
 
 		 823 aa  97.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03995  Peptidase M14, carboxypeptidase A  24.09 
 
 		 885 aa  96.3  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0478  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.52 
 
 		 863 aa  95.9  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  23.64 
 
 		 840 aa  95.5  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  21.6 
 
 		 816 aa  92  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0074  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.6 
 
 		 834 aa  91.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.34 
 
 		 837 aa  91.3  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0105  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.71 
 
 		 845 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4011  peptidase M14 carboxypeptidase A  20.94 
 
 		 850 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5203  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1057 aa  82  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0178  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.33 
 
 		 848 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2795  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.92 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0357907  normal  0.190508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2535  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.91 
 
 		 860 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.74 
 
 		 612 aa  54.7  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.9 
 
 		 631 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3503  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.88 
 
 		 831 aa  51.2  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.37 
 
 		 659 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  24.08 
 
 		 576 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.12 
 
 		 683 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  20.37 
 
 		 627 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.73 
 
 		 684 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  20.16 
 
 		 665 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.43 
 
 		 615 aa  48.9  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.88 
 
 		 619 aa  48.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.56 
 
 		 599 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  19.96 
 
 		 658 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.63 
 
 		 683 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  21.63 
 
 		 683 aa  46.2  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.78 
 
 		 618 aa  45.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.14 
 
 		 580 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  21.63 
 
 		 610 aa  44.3  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>