More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2116 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 384 aa  799    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  56.52 
 
 		 372 aa  438  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  48.81 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  36.52 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  36.54 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  36.86 
 
 		 374 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  36.75 
 
 		 372 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  36.19 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  36.13 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  35.08 
 
 		 387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  33.8 
 
 		 400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  36.02 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.95 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  35.96 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  34.38 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  33.79 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  34.44 
 
 		 397 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  36.31 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  33.79 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  33.79 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.34 
 
 		 403 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  32.04 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  33.15 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  33.05 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  34.11 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  30.36 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  33.72 
 
 		 403 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  33.52 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  29.78 
 
 		 404 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31.21 
 
 		 388 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  30.73 
 
 		 423 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  32.07 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  29.83 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  32.71 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  31.39 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  29 
 
 		 394 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  30.73 
 
 		 467 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  32.22 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  30.6 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  29.59 
 
 		 388 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  30.17 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  28.01 
 
 		 496 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  28.08 
 
 		 408 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  29.94 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.66 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  28.53 
 
 		 418 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  26.74 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 413 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  29.32 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  27.69 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  27.27 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  25.27 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  29.22 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  25.13 
 
 		 434 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.98 
 
 		 376 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  26.36 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  24.92 
 
 		 371 aa  90.5  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  27.99 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  24.05 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.84 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  24.44 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  24.64 
 
 		 385 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  25.16 
 
 		 376 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  26.11 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  22.19 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  25.66 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  25.69 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.95 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  26.26 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  24.42 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  23.64 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00340  kynurenine 3-monooxygenase, putative  22.61 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.303065  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  22.87 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  23.78 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  24.13 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  22.42 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.63 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07902  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.286901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  23.33 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  22.58 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  22.58 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  24.15 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  22.58 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  25.24 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  26.42 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  22.62 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  23.06 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  25.36 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  21.32 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2823  monooxygenase, FAD-binding  22.53 
 
 		 371 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.091542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  25.55 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>