More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_28470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
341 aa  660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.56 
 
 
333 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109315  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.35 
 
 
353 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0476  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
340 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0586  ABC transporter ATP-binding protein  28.19 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2824  ABC transporter related  36.18 
 
 
302 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0591  ABC transporter related  31.25 
 
 
321 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.99 
 
 
313 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.36 
 
 
331 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.67 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5083  ABC transporter related  38.26 
 
 
320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16913  hitchhiker  0.000556999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.75 
 
 
337 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.84 
 
 
380 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.57 
 
 
342 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.75 
 
 
309 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1055  ABC transporter related  37.22 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.758916  normal  0.126684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2364  ABC transporter related  39.56 
 
 
327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021349  normal  0.0168897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 
446 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.08 
 
 
338 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1429  ABC transporter related  39.4 
 
 
320 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.152844  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
322 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  39.74 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1744  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
325 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000031377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.23 
 
 
348 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.48 
 
 
368 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.26 
 
 
345 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.44 
 
 
343 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4260  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.86 
 
 
317 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.330062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 
327 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4346  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.86 
 
 
317 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0513204 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4639  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.86 
 
 
317 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.837669  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  31.72 
 
 
304 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
335 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.139774  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.28 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  34.5 
 
 
312 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.52 
 
 
316 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.56 
 
 
313 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 
311 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
334 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  36.65 
 
 
329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2896  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.74 
 
 
339 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
353 aa  139  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  35.87 
 
 
3786 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 
322 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 
332 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  33.77 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
311 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  36.56 
 
 
275 aa  136  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2064  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.15 
 
 
335 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
310 aa  136  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2042  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.99 
 
 
328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025568  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.84 
 
 
332 aa  135  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
321 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  32.9 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1840  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.71 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 
320 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24930  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.81 
 
 
325 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.56 
 
 
335 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0431  ABC transporter related  32.57 
 
 
278 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.739427  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3100  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  36.52 
 
 
239 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  37.71 
 
 
312 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  35.44 
 
 
275 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6251  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.14 
 
 
353 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382006  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2293  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 
327 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352429  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 
380 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0665  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.33 
 
 
341 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
359 aa  132  9e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  31.22 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
262 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.28 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.24 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011937  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  39.05 
 
 
320 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0537  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
321 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 
332 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.75 
 
 
334 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.56 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  34.22 
 
 
337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  38.57 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  33.68 
 
 
319 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0339  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 
351 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.261155  hitchhiker  0.00121447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.37 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
338 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.39 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  34.2 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4184  daunorubicin resistance ABC transporter ATP- binding subunit  39.35 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00696491  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6125  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 
403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  32.04 
 
 
317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  37.24 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4796  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.86 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  30.62 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>