253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2104 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  96.64 
 
 		 149 aa  298  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  97.32 
 
 		 149 aa  296  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  85.91 
 
 		 149 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  85.91 
 
 		 149 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  85.23 
 
 		 149 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  84.56 
 
 		 149 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  83.22 
 
 		 149 aa  254  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.52 
 
 		 154 aa  136  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.85 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.08 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  47.65 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.55 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.92 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  48.59 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  48.53 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  48.91 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.32 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  48.91 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  55.83 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.93 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.04 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  44.37 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 		 145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 		 163 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.07 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  45.07 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.76 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  51.59 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  49.24 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  50 
 
 		 157 aa  123  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  42.54 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.95 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.96 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  44.78 
 
 		 145 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.11 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.14 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  44.03 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.27 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.48 
 
 		 151 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.55 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  48.48 
 
 		 167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.32 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.13 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  51.13 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  51.13 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  47.66 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.95 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0737  alkylhydroperoxidase  46.56 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  45.95 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.51 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.48 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.24 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.85 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.27 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.94 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.69 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.62 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.07 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.29 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.86 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.76 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.14 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.14 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.14 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>