More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1512 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 225 aa  95.5  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1474  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0302671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0061  Orf34  30 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1562  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  29.19 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1304  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.45 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 240 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.62 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  33.81 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  33.09 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 634 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  34.78 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  33.09 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  33.09 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  33.09 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  34.78 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.4 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.78 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1407  hypothetical protein  33.88 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.709337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  33.59 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0393  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  35.78 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  28.19 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.62 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  32 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  30 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3571  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.103382  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.36 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.38 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  35.45 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 293 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.54 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.81 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4099  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  30.28 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4175  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 248 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  33.02 
 
 		 341 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 296 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.65 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.43 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.7 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.33 
 
 		 258 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>