54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3359 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  97.97 
 
 		 395 aa  794    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  85.57 
 
 		 395 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  99.24 
 
 		 395 aa  815    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 395 aa  823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  74.01 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  74.27 
 
 		 397 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  74.01 
 
 		 397 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  73.74 
 
 		 397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  55.56 
 
 		 388 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  54.93 
 
 		 386 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  53.21 
 
 		 402 aa  428  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  53.69 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  53.66 
 
 		 393 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  52.86 
 
 		 376 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  50.8 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  32.12 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  30.73 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  30.59 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.35 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  26.99 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.84 
 
 		 810 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 878 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 1112 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 		 571 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.37 
 
 		 579 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.23 
 
 		 725 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.1 
 
 		 957 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 263 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 718 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  26.44 
 
 		 587 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 586 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1251  FkbM family methyltransferase  26.67 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0112173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1038 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 243 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.1 
 
 		 733 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1660  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  29.82 
 
 		 661 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 		 582 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 263 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.73 
 
 		 1288 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 149 aa  43.5  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 968 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 183 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>