More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2663 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3402  elongation factor G  46.27 
 
 		 730 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312369 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6425  elongation factor G  47.7 
 
 		 681 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.63376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0222  elongation factor G  46.41 
 
 		 683 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3749  elongation factor G  48.25 
 
 		 688 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.158222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3200  elongation factor G  80.88 
 
 		 682 aa  1131    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  48.52 
 
 		 680 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3719  elongation factor G  49.4 
 
 		 700 aa  648    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252538 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000680  translation elongation factor G-related protein  46.13 
 
 		 674 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2663  elongation factor G  100 
 
 		 682 aa  1382    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1118  elongation factor G  71.45 
 
 		 682 aa  1010    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1266  elongation factor G  47.85 
 
 		 684 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.782059  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5542  elongation factor G  48.32 
 
 		 686 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1382  elongation factor G  45.31 
 
 		 684 aa  618  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4182  elongation factor G  47.48 
 
 		 686 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  35.66 
 
 		 695 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  36.23 
 
 		 691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  35.27 
 
 		 688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.06 
 
 		 692 aa  448  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  34.69 
 
 		 679 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.26 
 
 		 683 aa  432  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  35.35 
 
 		 690 aa  432  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  34.63 
 
 		 696 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  33.48 
 
 		 694 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  34.25 
 
 		 685 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.61 
 
 		 683 aa  425  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  35.23 
 
 		 696 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  35.54 
 
 		 680 aa  419  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  35.57 
 
 		 682 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  35.43 
 
 		 692 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  33.24 
 
 		 695 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0944  small GTP-binding protein  35.44 
 
 		 703 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.303462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0086  translation elongation factor G  34.9 
 
 		 701 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0717  small GTP-binding protein  34.4 
 
 		 696 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2931  elongation factor G  34.54 
 
 		 688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  34.92 
 
 		 683 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  33.05 
 
 		 691 aa  403  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.02 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  32.26 
 
 		 693 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2909  elongation factor G  35.13 
 
 		 686 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0135  small GTP-binding protein  35.45 
 
 		 699 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  32.8 
 
 		 691 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  34.88 
 
 		 691 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  33.75 
 
 		 698 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  34.1 
 
 		 673 aa  399  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  34.94 
 
 		 701 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0289  small GTP-binding protein  32.73 
 
 		 703 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0879  small GTP-binding protein  31.94 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.323736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  33.33 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  35.32 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  33.14 
 
 		 694 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  32.85 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  34.74 
 
 		 683 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  32.38 
 
 		 697 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  33.19 
 
 		 697 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  32.55 
 
 		 691 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  33.62 
 
 		 697 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  33.33 
 
 		 686 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1937  elongation factor G  34.15 
 
 		 685 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  36.24 
 
 		 677 aa  395  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.35 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.01 
 
 		 682 aa  395  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.09 
 
 		 701 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  34.29 
 
 		 690 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0185  elongation factor G  32.66 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.52749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  32.85 
 
 		 692 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  32.62 
 
 		 693 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  33.1 
 
 		 701 aa  392  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  32.27 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  31.76 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0124  translation elongation factor G  34.97 
 
 		 707 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  33.43 
 
 		 670 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  32.8 
 
 		 689 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1785  elongation factor G  34.4 
 
 		 687 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  32.53 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  32.14 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  33 
 
 		 704 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  33.29 
 
 		 707 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  32.38 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  31.66 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  32.14 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  32.52 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  34.05 
 
 		 690 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  32.53 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  31.68 
 
 		 696 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  31.97 
 
 		 685 aa  387  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  34.05 
 
 		 687 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  32.52 
 
 		 692 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  32.14 
 
 		 694 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  35.11 
 
 		 681 aa  384  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  32.43 
 
 		 692 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  31.83 
 
 		 691 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  32.39 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0277  elongation factor G  31.63 
 
 		 690 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000480322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  32.39 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  32.29 
 
 		 692 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  32.43 
 
 		 692 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  33.72 
 
 		 690 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  31.83 
 
 		 691 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  32.32 
 
 		 691 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  31.75 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>