32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0929 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0929  Ig family protein  100 
 
 		 1025 aa  2077    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  35.93 
 
 		 3244 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  26.95 
 
 		 1215 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  26.95 
 
 		 1215 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  36.59 
 
 		 1148 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  39.02 
 
 		 2506 aa  55.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  41.03 
 
 		 1016 aa  55.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  31.62 
 
 		 2079 aa  53.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.2 
 
 		 3699 aa  53.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.06 
 
 		 3699 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 1212 aa  52.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  26.48 
 
 		 1779 aa  52.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  36.73 
 
 		 622 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 688 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  34.09 
 
 		 376 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.06 
 
 		 674 aa  50.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2169 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.91 
 
 		 815 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3189  hypothetical protein  26.61 
 
 		 611 aa  48.5  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  30.26 
 
 		 1002 aa  48.1  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2233 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30.77 
 
 		 3544 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  38.95 
 
 		 726 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.7 
 
 		 597 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  33.58 
 
 		 672 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0834  hypothetical protein  26.61 
 
 		 611 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.76 
 
 		 816 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.29 
 
 		 962 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1879 aa  45.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.91 
 
 		 1321 aa  45.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.62 
 
 		 1072 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.91 
 
 		 1338 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>