More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0779 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  86.89 
 
 		 450 aa  758    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  87.08 
 
 		 450 aa  780    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  81.82 
 
 		 451 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  82.04 
 
 		 451 aa  738    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  83.37 
 
 		 451 aa  745    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  73.72 
 
 		 449 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  82.04 
 
 		 451 aa  735    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  83.37 
 
 		 451 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  83.15 
 
 		 451 aa  746    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  81.66 
 
 		 459 aa  705    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  80.18 
 
 		 456 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  83.37 
 
 		 451 aa  746    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  80.89 
 
 		 452 aa  719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  81.82 
 
 		 451 aa  735    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  100 
 
 		 452 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  83.52 
 
 		 451 aa  741    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  60.49 
 
 		 455 aa  529  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  58.65 
 
 		 451 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  58.8 
 
 		 455 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  58.48 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  57.59 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  57.4 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  58.93 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  56.18 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  56.4 
 
 		 450 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  57.62 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  57.62 
 
 		 461 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  57.4 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  59.51 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  59.51 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  59.51 
 
 		 449 aa  485  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  59.96 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  59.06 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  59.06 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  59.28 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  59.96 
 
 		 449 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  59.28 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  59.96 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  59.06 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  59.96 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  59.73 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  58.84 
 
 		 449 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  52.2 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  51.22 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  50.22 
 
 		 452 aa  404  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  39.02 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  38.68 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  37.76 
 
 		 471 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  38.77 
 
 		 471 aa  279  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  38.96 
 
 		 469 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  39.35 
 
 		 471 aa  277  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  35.64 
 
 		 471 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  37.71 
 
 		 471 aa  267  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  35.49 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  37.74 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  34.6 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  34.51 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  34.13 
 
 		 817 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  34.14 
 
 		 541 aa  240  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  35.73 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.82 
 
 		 815 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  34.29 
 
 		 437 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  36.09 
 
 		 823 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  39.7 
 
 		 450 aa  233  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.54 
 
 		 818 aa  226  9e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  35.22 
 
 		 878 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.62 
 
 		 815 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.26 
 
 		 859 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3187  aspartate kinase  35.27 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0425815  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3152  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.85 
 
 		 818 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.817335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  32.99 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  33.26 
 
 		 814 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1253  aspartate kinase  32.77 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.312523  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  32.84 
 
 		 859 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0401  aspartate kinase  33.33 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.271601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1138  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.65 
 
 		 822 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.592327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1139  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.93 
 
 		 822 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0421485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  32.69 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1209  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.65 
 
 		 822 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2735  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.85 
 
 		 822 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.331448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  32.89 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  34.56 
 
 		 868 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  34.56 
 
 		 868 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1271  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.63 
 
 		 822 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.279623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3415  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.72 
 
 		 822 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1304  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.63 
 
 		 822 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3086  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.63 
 
 		 822 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  35.18 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1227  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.63 
 
 		 822 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.248469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3079  aspartate kinase  37.08 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244781  hitchhiker  0.00296029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  31.85 
 
 		 815 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1175  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.77 
 
 		 821 aa  200  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  33.48 
 
 		 463 aa  199  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0861  aspartate kinase  31.93 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0535  aspartate kinase  33.33 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2906  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.93 
 
 		 821 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.98 
 
 		 857 aa  197  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  30.57 
 
 		 465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.04 
 
 		 864 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.12 
 
 		 818 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>