56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0641 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0745  hypothetical protein  71.05 
 
 		 114 aa  174  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0711  hypothetical protein  53.98 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2872  hypothetical protein  44.9 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.429603  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2492  protein of unknown function DUF192  44.9 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2306  protein of unknown function DUF192  38.6 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2697  hypothetical protein  41.58 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2119  hypothetical protein  41.41 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.549262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2697  protein of unknown function DUF192  43.43 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113604  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0735  hypothetical protein  41.05 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000467927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2113  protein of unknown function DUF192  42.71 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1046  protein of unknown function DUF192  32.71 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4349  hypothetical protein  34.51 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2313  protein of unknown function DUF192  35 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2924  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3213  protein of unknown function DUF192  41.76 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  0.317826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6879  protein of unknown function DUF192  32.65 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364681  normal  0.213508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1044  protein of unknown function DUF192  35.19 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.646294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3209  protein of unknown function DUF192  37.62 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.594469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1052  protein of unknown function DUF192  36.7 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4616  hypothetical protein  30.48 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0250  hypothetical protein  52.38 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0760  protein of unknown function DUF192  36.56 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1775  protein of unknown function DUF192  29.73 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.216631  normal  0.993279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1232  hypothetical protein  30.65 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2572  protein of unknown function DUF192  33.01 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0546  protein of unknown function DUF192  38.6 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.631878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06040  hypothetical protein  31.31 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1277  hypothetical protein  32.58 
 
 		 123 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1679  hypothetical protein  32.29 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000505781 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20090  hypothetical protein  32.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.195136  normal  0.669354 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2042  protein of unknown function DUF192  34 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.737978  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1138  hypothetical protein  30.21 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1050  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13070  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.698852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0879  protein of unknown function DUF192  32.58 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2050  hypothetical protein  29.09 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000014639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0477  protein of unknown function DUF192  30.61 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1608  hypothetical protein  31.53 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0335405  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1732  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1199  hypothetical protein  26.51 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.826524  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2141  hypothetical protein  31.53 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.969558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1019  hypothetical protein  29.67 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3905  protein of unknown function DUF192  27.88 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0679717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4714  protein of unknown function DUF192  29.79 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195502  normal  0.0114634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2350  protein of unknown function DUF192  30.97 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2299  protein of unknown function DUF192  30.97 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1662  hypothetical protein  27.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0927  hypothetical protein  29.67 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1497  hypothetical protein  30.43 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.868857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0823  hypothetical protein  27.59 
 
 		 165 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1787  hypothetical protein  28.33 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000591918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1551  hypothetical protein  28.7 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.974386  normal  0.679368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1823  hypothetical protein  31.96 
 
 		 446 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0461  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0550  protein of unknown function DUF192  27.59 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>