More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0488 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  54.84 
 
 		 114 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  57.3 
 
 		 102 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  57.3 
 
 		 102 aa  117  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1906  transcriptional regulator, ArsR family  51.11 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.161865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  52.69 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  55.42 
 
 		 114 aa  99.4  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4017  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 111 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.980499  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 113 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  41.35 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 		 114 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  44.09 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  40.18 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 100 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20100  regulatory protein ArsR  41.38 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  47.06 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  43.94 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  41.25 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  44.44 
 
 		 118 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  51.52 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3446  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3509  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3457  ArsR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446106  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  40 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  32.89 
 
 		 108 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  44.09 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  39.02 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  39.78 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  42.17 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  46.58 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  38.96 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2718  regulatory protein, ArsR  39 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  43.82 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3819  regulatory protein, ArsR  43.24 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588527  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4184  regulatory protein ArsR  38.6 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  46.99 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 221 aa  63.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4845  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  53.73 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2504  transcriptional regulator, ArsR family  40.48 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.391076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1884  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172075 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.63 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.66 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4035  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4718  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  52.31 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  42.68 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  41.25 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3554  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  37.36 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  47.83 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2845  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>