37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1841 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1841  phage integrase family protein  100 
 
 		 394 aa  820    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  40.55 
 
 		 380 aa  292  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2269  phage integrase family protein  39.25 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0691132  hitchhiker  0.00139304 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  38.5 
 
 		 372 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1248  phage integrase family protein  38.5 
 
 		 372 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0661784  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1415  phage integrase family site specific recombinase  36.66 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0278227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1744  site-specific recombinase, phage integrase family  36.41 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000266789  hitchhiker  0.000213416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1821  site-specific recombinase, phage integrase family  36.16 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0160439  hitchhiker  0.00000000000638112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3178  site-specific recombinase, phage integrase family  36.16 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0439431  hitchhiker  0.000000000000369688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1426  site-specific recombinase, phage integrase family  36.16 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0270724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0656  Phage integrase  37 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  40.62 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  35.68 
 
 		 368 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  41.09 
 
 		 260 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1674  lambda integrase  34.96 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1011  integrase-like protein  32.41 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2029  phage integrase  35.2 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.0993134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2023  phage integrase  34.87 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280518  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1379  phage integrase  35.86 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000565692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2084  integrase  34.87 
 
 		 284 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1432  integrase  35.53 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00370653  normal  0.301971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 356 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  30.69 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  30.69 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2426  integrase family protein  29.3 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  31.68 
 
 		 312 aa  140  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00705  hypothetical protein  29.21 
 
 		 304 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7378  hypothetical protein  31.68 
 
 		 194 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0269984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0688  phage integrase  31.8 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000188097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2016  putative cytoplasmic protein  38.26 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2069  hypothetical protein  38.26 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2577  hypothetical protein  26.03 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1255  integrase  37.04 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1711  phage integrase family site specific recombinase  27.12 
 
 		 412 aa  53.1  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.109481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1428  hypothetical protein  53.06 
 
 		 72 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00702  hypothetical protein  52 
 
 		 54 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000701341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  23.93 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>